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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001366`

染色体: Chr08 坐标: 10897511-10898461 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001366`
名称	SmilChr08G001366
描述	uncharacterized SmilChr08G001366
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	10897511 - 10898461 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000916`
GeneID	`131000916`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000916`
原始查询	`SmilChr08G001366`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824244]; symbol=AT3G50800; hit=AT3G50800; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824244]; symbol=AT3G50800; hit=AT3G50800; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G50800` (AT3G50800) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824244] identity=53.5; qcov=0.493; evalue=6.2e-27; confidence=medium
Rice	`Os09g0492900` - identity=35.3; qcov=0.732; evalue=1.03e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14009 (PADRE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000916

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783045.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057783045.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057783045.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057783045.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:10897759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A3,B70,B78
`Chr8:10897846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:10898067`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	117	A10,A15,A19,A2,A20,A21,A25,A3,A4,A7,A9,B1,B10,B101,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B118,B12,B121,B123,B124,B13,B133,B134,B135,B136,B138,B14,B15,B18,B19,B21,B22,B24,B25,B3,B32,B35,B38,B39,B40,B41,B44,B46,B5,B50,B51,B53,B58,B59,B6,B61,B62,B64,B65,B66,B69,B7,B71,B72,B75,B76,B79,B82,B89,B94,B95,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C15,C16,C20,C22,C26,C31,C33,C34,C35,C39,C45,C47,C50,C51,C54,C55,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C78,C79,C80,C81,C85,C9,D3,D4,D5,D9
`Chr8:10898088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A3,B70,B78
`Chr8:10898122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B133,D7
`Chr8:10898126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783045.1

205 aa

102

205

PADRE

PF14009 PADRE 32-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783045.1`	Pfam	`PF14009`	PADRE	Domain	32	139	2.6e-19	71.0	PADRE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927062.1
TCAAAATTCAAATATGGTCCTCCCTCAATTTAAGTCCAAACAAGGACGGATGAAACGACGTGACAACAATGAAAATAATTGTTTGAAAAATGCATGCAACGCATCTCAATTTCCCACTATATAAATAAGTACCAAAATTCGATTTTATTCTTCACACAAATTCCTTATTCCTTTGCTCCCAAATTCATGGGAAATTACAGATCATGCGAGTCAAGATCCACTCTCACAGCAAAACTAATCCTCGTCGGCGGCCAACTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000916
ATGCAACGCATCTCAATTTCCCACTATATAAATAAGTACCAAAATTCGATTTTATTCTTCACACAAATTCCTTATTCCTTTGCTCCCAAATTCATGGGAAATTACAGATCATGCGAGTCAAGATCCACTCTCACAGCAAAACTAATCCTCGTCGGCGGCCAACTCCAAGAATTTCTATGGCCGGTTAGGGTTTCGCTATTGCTGCCGCGAGATTCCGATTGCTTCATATGCAGCTCCGACGAGATGGAATTCGGCGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783045.1
MQRISISHYINKYQNSILFFTQIPYSFAPKFMGNYRSCESRSTLTAKLILVGGQLQEFLWPVRVSLLLPRDSDCFICSSDEMEFGEFPAAMGGNEVLQPGEIYFELPLAWRNVRLQAEDMAVLALKASVALASKARDDDDDDRIISSCCCCFRIRSRRAEPAALFCEKEMPLLAGDQGGRRGRGKGGAGAAPNKFVAKLTAILED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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