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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001382`

染色体: Chr08 坐标: 11017590-11019051 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001382`
名称	SmilChr08G001382
描述	flavonoid 4'-O-methyltransferase 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11017590 - 11019051 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000869`
GeneID	`131000869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000869`
原始查询	`SmilChr08G001382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flavonoid 4'-O-methyltransferase 3-like
产物	flavonoid 4'-O-methyltransferase 3-like
Arabidopsis	`AT4G35160` (AT4G35160) O-methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829668] identity=42.8; qcov=1.03; evalue=4.84e-87; confidence=medium
Rice	`Os12g0441300` - identity=34.1; qcov=1.02; evalue=2.68e-61; confidence=low
GO	GO:0008171 (O-methyltransferase activity); GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0019438 (GO:0019438); GO:0032259 (methylation); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00891 (Methyltransf_2); PF08100 (Dimerisation)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057782981.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057782981.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782981.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782981.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782981.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11017744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11017888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11018227`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C60
`Chr8:11018227`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C60
`Chr8:11018612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B17,B73,C3,C82
`Chr8:11018627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr8:11018628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B8,B94,C28,C61
`Chr8:11018634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B8,B94,C28,C61
`Chr8:11018670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:11018675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:11018676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:11018682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782981.1

343 aa

172

343

Dimerisation

Methyltransf_2

PF08100 Dimerisation 17-99 aa PF00891 Methyltransf_2 121-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782981.1`	Pfam	`PF08100`	Dimerisation	Domain	17	99	1.5e-18	67.2	O-methyltransferase dimerisation domain
`XP_057782981.1`	Pfam	`PF00891`	Methyltransf_2	Domain	121	324	2.3e-49	168.3	O-methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926998.1
CTATAGTTCTAATTTGTCATTTTGAACCATTCATAAAAGTTGTTCTAATTTATTTTATTAAATTTATGGATCTTTTTCTTCACTCATTAAAATAGTAAAATATAGGCCTATTTCTCCACTCACTTACTAAACGAAGATGGCAGAATCAAAAGGCACCATCACAGCCGACGCGAAACTGGAGATGTGGAGGTGCGCCTTGGGCTTCACTCCGACCGCCGTAGTCAGATGCACCATCGAGCTCCAAATCGCCGACGTCATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000869
ATGGCAGAATCAAAAGGCACCATCACAGCCGACGCGAAACTGGAGATGTGGAGGTGCGCCTTGGGCTTCACTCCGACCGCCGTAGTCAGATGCACCATCGAGCTCCAAATCGCCGACGTCATGGACTCCCACGGCGGCACCATGACGCACGGCGACCTCTCCGCCGCCGTGGGTTGCTCGCCAACAATCCTCCGCCGTATTATGCGGTACCTGGTCCACCGACGTTTCTTCAAGCAGACGGTCACCTCGTCAAAGGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782981.1
MAESKGTITADAKLEMWRCALGFTPTAVVRCTIELQIADVMDSHGGTMTHGDLSAAVGCSPTILRRIMRYLVHRRFFKQTVTSSKVSYVQTPLSRLLMRNGDESMAAFILLESSPTALAPWNRLSSRARESGGSTFEEEHGSDIWSYTDVNPAHSKLFDDAMSCVAKVSAAAIVNQYPKALEGIESLVDVGGGDGTALRILLKAFPRIHGINFDRPSVVSVAAPPSQGIQHVAGSMFEAVPNADAAFLMSVLHDWNDEEC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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