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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001387`

染色体: Chr08 坐标: 11076283-11078047 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001387`
名称	SmilChr08G001387
描述	uncharacterized SmilChr08G001387
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11076283 - 11078047 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998069`
GeneID	`130998069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998069`
原始查询	`SmilChr08G001387`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=46.7; qcov=0.451; evalue=4.48e-69; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779486.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779486.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779486.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779486.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779486.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11076294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C53
`Chr8:11076453`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A13,A2,A3,B1,B10,B105,B135,B16,B2,B50,B55,B56,B6,B65,B77,B78,B79,B80,B82,B86,B96,B99,C16,C18,C38,C39,C4,C43,C48,C67,C68,C72,C73,C75,C78,C83,C87,D10,D4
`Chr8:11076675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:11076896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B120,B82
`Chr8:11077005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:11077470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C65
`Chr8:11077635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B68,C44,C66
`Chr8:11077656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B68,C44,C66
`Chr8:11077661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B68,C44,C66
`Chr8:11077671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B68,C44,C66
`Chr8:11077761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr8:11077871`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B12,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779486.1

536 aa

268

536

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 137-239 aa PF13952 DUF4216 406-474 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779486.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	137	239	8.6e-43	145.5	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057779486.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	406	474	3.4e-22	79.5	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923503.1
ATGCACATCGAAAAAAATGTTCTAGAAAGTCTAATCGGTACATTGCTGGATATTCCTGGGAAAACCAAGGATGGAGTTGCTGCGAGAATGGATTTGGTACACATGGGTGTGCGAAATGAGTTAGCACCAACTGTGGTTGGGAAGAAGACATGTTTGCCGCCTGCATGTTATACACTTACTAAAGAGGAGAAGCGCAAAGTCTGTACTTCATTTCTTGGAATGAAGTTTCCCGATGGATATTCTTCAAACATTAGTAAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998069
ATGCACATCGAAAAAAATGTTCTAGAAAGTCTAATCGGTACATTGCTGGATATTCCTGGGAAAACCAAGGATGGAGTTGCTGCGAGAATGGATTTGGTACACATGGGTGTGCGAAATGAGTTAGCACCAACTGTGGTTGGGAAGAAGACATGTTTGCCGCCTGCATGTTATACACTTACTAAAGAGGAGAAGCGCAAAGTCTGTACTTCATTTCTTGGAATGAAGTTTCCCGATGGATATTCTTCAAACATTAGTAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779486.1
MHIEKNVLESLIGTLLDIPGKTKDGVAARMDLVHMGVRNELAPTVVGKKTCLPPACYTLTKEEKRKVCTSFLGMKFPDGYSSNISKLVSMKDLKLSGLKSHDCHVLMQQLLPIAICGVLPKHVRIAITRLCHFFNDICNKEIDVPRLEVIQKDIVTTLCLLEKYFTPSFFDIMVHLTVHLVREVKLCGPVWYRWMYPFERYMKILKGYVRNRHRPEGCIAESYIVEEAVEYCSEYLANTYTIGIPSSNLKDNLTESSSRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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