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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001400`

染色体: Chr08 坐标: 11213723-11214343 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001400`
名称	SmilChr08G001400
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11213723 - 11214343 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998072`
GeneID	`130998072`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998072`
原始查询	`SmilChr08G001400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
产物	leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
Arabidopsis	`AT5G61480` (PXY) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836269] identity=41.6; qcov=0.922; evalue=1.77e-38; confidence=medium
Rice	`Os02g0111800` (OsCLVATA) - identity=39.4; qcov=0.874; evalue=4.78e-33; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998072

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057779488.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779488.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779488.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779488.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11213721`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	167	A10,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B108,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B124,B127,B128,B13,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B29,B30,B32,B34,B35,B4,B45,B46,B48,B51,B53,B55,B57,B58,B6,B61,B63,B67,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B8,B80,B81,B82,B86,B87,B88,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C76,C78,C79,C8,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D8,D9
`Chr8:11213724`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	167	A10,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B108,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B124,B127,B128,B13,B130,B131,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B29,B30,B32,B34,B35,B4,B45,B46,B48,B51,B53,B55,B57,B58,B6,B61,B63,B66,B67,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B8,B80,B81,B82,B86,B87,B88,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C2,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C76,C78,C79,C8,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D8,D9
`Chr8:11213731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B2,C15
`Chr8:11213792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr8:11213826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:11213827`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	112	A15,A18,A19,A2,A21,A23,A3,A4,A5,A7,A9,B10,B100,B101,B102,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B124,B128,B130,B131,B133,B134,B136,B138,B15,B16,B17,B19,B20,B22,B25,B26,B34,B4,B44,B51,B53,B55,B56,B57,B6,B61,B68,B71,B72,B73,B74,B77,B80,B81,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B95,B97,B98,B99,C1,C17,C18,C2,C21,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C34,C36,C37,C38,C4,C42,C44,C46,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C57,C58,C61,C64,C66,C67,C68,C7,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C84,C87,D3,D4,D8
`Chr8:11213837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:11213903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	50	A15,A25,A3,B100,B11,B125,B13,B130,B133,B16,B17,B19,B22,B25,B4,B44,B50,B51,B6,B71,B92,B95,B97,B98,C17,C21,C29,C32,C34,C37,C38,C39,C44,C48,C51,C54,C62,C64,C66,C67,C68,C70,C74,C77,C8,C80,C85,D3,D4,D8
`Chr8:11213991`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B77,C19
`Chr8:11213991`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B77,C19
`Chr8:11213994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B82
`Chr8:11214087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	237	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D6,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779488.1

206 aa

103

206

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF00560 LRR_1 2-21 aa PF00560 LRR_1 23-44 aa PF13855 LRR_8 71-130 aa PF00560 LRR_1 72-93 aa PF00560 LRR_1 96-115 aa PF00560 LRR_1 119-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779488.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	2	21	1.7e-16	57.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057779488.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	23	44	1.7e-16	57.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057779488.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	71	130	4.2e-12	46.3	Leucine rich repeat
`XP_057779488.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	72	93	1.7e-16	57.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057779488.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	96	115	1.7e-16	57.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057779488.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	119	139	1.7e-16	57.5	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923505.1
ATGCATCTGGACATTTCCTCCGCCAATCTCTCAGGCGATCTCCCGCCGGAGCTCGGGAGATTGGCAAAACTGGAGATGCTATTTCTCTTCAAGAACAACCTCTCCGGGATCGATCCCGACAGCCTGGGGTCAGTTGCAGTCGTTGCGAGAACTAGATTTATCCTCCAACAATCTCTCCGGCGAAATCCCACCGATTTATCGGCACTGAAAGCCCTAACCAGATTATCCTTGATGAACAACAATTTAACGGGAGAAATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998072
ATGCATCTGGACATTTCCTCCGCCAATCTCTCAGGCGATCTCCCGCCGGAGCTCGGGAGATTGGCAAAACTGGAGATGCTATTTCTCTTCAAGAACAACCTCTCCGGGATCGATCCCGACAGCCTGGGGTCAGTTGCAGTCGTTGCGAGAACTAGATTTATCCTCCAACAATCTCTCCGGCGAAATCCCACCGATTTATCGGCACTGAAAGCCCTAACCAGATTATCCTTGATGAACAACAATTTAACGGGAGAAATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779488.1
MHLDISSANLSGDLPPELGRLAKLEMLFLFKNNLSGIDPDSLGSVAVVARTRFILQQSLRRNPTDLSALKALTRLSLMNNNLTGEIPQGIGELPDLKILSLWNNSFSGILPQSLGYHSRLEWLDVSSNSLTGAIPQKLCCGGALGEAATVFKPICWGDPFVFSQMRGVIACENPRQPRGRGVLEFRQRDHRDGICGDGVQGRDGRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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