当前解析结果
SmilChr08G001403| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001403 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001403 |
| 描述 | BTB/POZ domain-containing protein At1g63850-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 11247879 - 11250317 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131000952 |
|---|---|
| GeneID | 131000952 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131000952 |
| 原始查询 | SmilChr08G001403 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BTB/POZ domain-containing protein At1g63850-like |
| 产物 | BTB/POZ domain-containing protein At1g63850-like |
| Arabidopsis | AT1G63850 (AT1G63850)BTB/POZ domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842688] identity=26.6; qcov=0.892; evalue=3.63e-23; confidence=low |
| Rice | Os03g0723600- identity=50.7; qcov=0.876; evalue=3.38e-137; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF25553 (BTB-POZ_ANK-like) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131000952 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783088.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057783088.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057783088.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783088.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783088.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:11248301 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A2 |
Chr8:11248522 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr8:11249195 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr8:11250064 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783088.1PF25553
BTB-POZ_ANK-like 298-497 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783088.1 |
Pfam | PF25553 |
BTB-POZ_ANK-like | Repeat | 298 | 497 | 9e-10 | 39.1 | BTB/POZ Ankyrin-like repeat |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。