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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001406`

染色体: Chr08 坐标: 11261823-11267657 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001406`
名称	SmilChr08G001406
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11261823 - 11267657 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000951`
GeneID	`131000951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000951`
原始查询	`SmilChr08G001406`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
Arabidopsis	`AT2G16250` (AT2G16250) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816121] identity=60.9; qcov=0.909; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0724300` - identity=49.9; qcov=0.784; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783087.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783087.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783087.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783087.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11262267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11263669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:11263677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr8:11265056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11265428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:11265573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C62
`Chr8:11265575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C45,C80
`Chr8:11265841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C62
`Chr8:11265964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:11266258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11266695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:11266786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B69,B95,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783087.1

903 aa

452

903

LRR_8

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF13855 LRR_8 126-186 aa PF23598 LRR_14 126-330 aa PF00560 LRR_1 127-149 aa PF00560 LRR_1 155-173 aa PF00560 LRR_1 176-197 aa PF13855 LRR_8 193-234 aa PF00560 LRR_1 199-221 aa PF00560 LRR_1 223-245 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 528-744 aa PF00069 Pkinase 529-801 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	126	186	2e-23	82.6	Leucine rich repeat
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	126	330	1e-12	48.3	Leucine-rich repeat region
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	127	149	6.4e-22	73.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	155	173	6.4e-22	73.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	176	197	6.4e-22	73.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	193	234	2e-23	82.6	Leucine rich repeat
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	199	221	6.4e-22	73.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	223	245	6.4e-22	73.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	528	744	1.3e-21	77.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057783087.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	529	801	3e-15	57.1	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927104.1
TATTGGGCGGGATTTTCGGCGGTCAAACACTTAAACGGGTCACACACTAATTCCCCATCCGGATAAGGCCCGACCCGGACCGACCCGTATGCATCCGCCGCCGATGAAACTTTCTAAAATTTTCAGAGAGATAAAAACAGTCGTAGAGCTCTCAAACCTTTTTCCCTCTGCGCGCGATAATTCATCCTAGAGAGAGACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGTGGTCCGAAGTCTGAACTTCGCCTTTTTCTCTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000951
ATGGTGGATCGGTGGAGCAGGGTAGGTTTAATTTTTGTAGCTTCATTTTTCTTTCTGTTTGTGCATACATTGGAGCAGCAATTGCTGGTGTCAAGGCAAGAGAGATTGGCTTTGATTCAACTGAGATCTTCGTTAGGGTTGAAAGCGAGGTATTGGCCTATTAAATCCGACCCGTGCACTTCATGGGCGGGTATACAATGCATCAATGGCAGGGTTACAGGAATCAATATATCAGGGTTCAGGAGAACTCGGAGGGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783087.1
MVDRWSRVGLIFVASFFFLFVHTLEQQLLVSRQERLALIQLRSSLGLKARYWPIKSDPCTSWAGIQCINGRVTGINISGFRRTRRGSRNPQFSVDALRNLTLLSSFNASNFALVGSIPDWFGLQLPSLQVLDLRSCFINGAIPLTLGNLSSVIGLYLSDNNLTSVVPPSLGQLVGLSMLDLSRNLLTGSIPPTFGDLGNLTLLDLSSNFLSGAIPAGIATLSRLQFLNLSGNSLSSSIPAQLGNLSGLVELDLGFNSLSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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