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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001415`

染色体: Chr08 坐标: 11331363-11334807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001415`
名称	SmilChr08G001415
描述	chromatin remodeling protein SHL-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11331363 - 11334807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000961`
GeneID	`131000961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000961`
原始查询	`SmilChr08G001415`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chromatin remodeling protein SHL-like
产物	chromatin remodeling protein SHL-like
Arabidopsis	`AT4G39100` (SHL1) PHD finger family protein / bromo-adjacent homology (BAH) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830065] identity=76.7; qcov=1; evalue=2.59e-97; confidence=high
Rice	`Os07g0186400` - identity=73.2; qcov=1.01; evalue=6.94e-93; confidence=high
GO	GO:0003682 (chromatin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF01426 (BAH); PF30811 (PHD_UBR7-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783096.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057783096.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783096.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783096.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11331717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11334170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr8:11334437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B2,C15
`Chr8:11334477`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr8:11334477`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr8:11334480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783096.1

216 aa

108

216

BAH

PHD_UBR7-like

PHD

PF01426 BAH 22-135 aa PF30811 PHD_UBR7-like 140-190 aa PF00628 PHD 142-187 aa

XP_057783097.1

163 aa

163

BAH

PF01426 BAH 22-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783096.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	22	135	1.4e-23	83.8	BAH domain
`XP_057783096.1`	Pfam	`PF30811`	PHD_UBR7-like	Domain	140	190	2.2e-09	37.9	UBR7-like PHD finger
`XP_057783096.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	142	187	4.4e-08	33.7	PHD-finger
`XP_057783097.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	22	135	2.7e-23	82.9	BAH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927113.1
AAAAGATATTGGAGTTGGAATTTGGATTAATAAAAGCGGGCGTGGGCTCTCTCTCTCTAGGAGTATCTATCTTGGCTACATGTACTCTCTCTCTCCTCCGCTCCTCCTCCGTACATCACATGGCTAAAGCCAAAGCCGCCCGCCGCACTCTCGACTCCTACTCCGTCAAGCATATCAACAAGACCATCCGCCCCGGGGACTGCCTCTTGATGCGGCCGTCGGAGTCATCAAAGCCGTCGTACGTCGCGCGTCTGGAGAAA...

XM_057927114.1
TGGAATTTGGATTAATAAAAGCGGGCGTGGGCTCTCTCTCTCTAGGAGTATCTATCTTGGCTACATGTACTCTCTCTCTCCTCCGCTCCTCCTCCGTACATCACATGGCTAAAGCCAAAGCCGCCCGCCGCACTCTCGACTCCTACTCCGTCAAGCATATCAACAAGACCATCCGCCCCGGGGACTGCCTCTTGATGCGGCCGTCGGAGTCATCAAAGCCGTCGTACGTCGCGCGTCTGGAGAAAATCGAGGCGGACAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000961
ATGGCTAAAGCCAAAGCCGCCCGCCGCACTCTCGACTCCTACTCCGTCAAGCATATCAACAAGACCATCCGCCCCGGGGACTGCCTCTTGATGCGGCCGTCGGAGTCATCAAAGCCGTCGTACGTCGCGCGTCTGGAGAAAATCGAGGCGGACAGCCGCGGCGCGAACGTGAGGATCCACGTGAGGTGGTATTACCGGCCGGAGGAATCGATCGGTGGCCGCCGCCAATTCCACGGCTCGAAGGAGGTATTTTTGTCCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783096.1
MAKAKAARRTLDSYSVKHINKTIRPGDCLLMRPSESSKPSYVARLEKIEADSRGANVRIHVRWYYRPEESIGGRRQFHGSKEVFLSDHFDIQSADTIEGKCTVHSFKSYTKLDAVGNEDFFCRFEYNSSTGAFNPDRVAVYCKCEMPYNPDDLMVQCEGCSDWFHPTCIDMTVEEAKRIDHFYCHNCSSEDQKKLQESHVSTRSADVKVDTKRRRR

XP_057783097.1
MAKAKAARRTLDSYSVKHINKTIRPGDCLLMRPSESSKPSYVARLEKIEADSRGANVRIHVRWYYRPEESIGGRRQFHGSKEVFLSDHFDIQSADTIEGKCTVHSFKSYTKLDAVGNEDFFCRFEYNSSTGAFNPDRVAVYCKCEMPYNPDDLMVQCEGCSDW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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