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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001419`

染色体: Chr08 坐标: 11354642-11355211 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001419`
名称	SmilChr08G001419
描述	uncharacterized protein At4g02000-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11354642 - 11355211 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998074`
GeneID	`130998074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998074`
原始查询	`SmilChr08G001419`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G31430` (AT3G31430) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822909] identity=32; qcov=0.926; evalue=1.3e-15; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=31.7; qcov=0.884; evalue=9.09e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779491.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779491.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779491.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779491.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779491.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11354697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B104,B82
`Chr8:11354713`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A22,A24,B1,B108,B11,B113,B125,B126,B129,B13,B132,B18,B19,B23,B3,B30,B35,B41,B51,B54,B59,B63,B7,B72,B74,B86,B90,B92,B94,B97,C2,C21,C26,C36,C57,C6,C71,C78,C86,C9,D1,D10,D11,D3,D5
`Chr8:11354722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B26,B68,C39
`Chr8:11354741`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B22,B26,B68,C39
`Chr8:11354741`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B22,B26,B68,C39
`Chr8:11354744`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B22,B26,B68,C39
`Chr8:11354744`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B22,B26,B68,C39
`Chr8:11354764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:11354813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B122,C22,D5
`Chr8:11354820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B131,C30,C64,C66
`Chr8:11354830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr8:11354833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779491.1

189 aa

189

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 1-53 aa PF14392 zf-CCHC_4 119-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779491.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	1	53	1.8e-12	47.5	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057779491.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	119	164	1.7e-18	66.7	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923508.1
ATGGCTAGTATCTGGCGACCGGGCAAGGGAGTATTCATGAAAGATATCGGTAAAGGGAGATTCATATTCCAATTTTTTCACGAACTAGATCTGAAGCGAGTTTACGAGGGAGGGCCTTGGGCGTTTGGTAATTTCCCTTTAATTCTCCATCGATTGAGGAAAGGAGAGTTCCCGCTTACTGTTCCGTTGGACATCCTGCCTTTTTGGGTCCAAATCCATGATCTTCTTGCTGGATTTTTGACGGAAGGGGTAGGCAAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998074
ATGGCTAGTATCTGGCGACCGGGCAAGGGAGTATTCATGAAAGATATCGGTAAAGGGAGATTCATATTCCAATTTTTTCACGAACTAGATCTGAAGCGAGTTTACGAGGGAGGGCCTTGGGCGTTTGGTAATTTCCCTTTAATTCTCCATCGATTGAGGAAAGGAGAGTTCCCGCTTACTGTTCCGTTGGACATCCTGCCTTTTTGGGTCCAAATCCATGATCTTCTTGCTGGATTTTTGACGGAAGGGGTAGGCAAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779491.1
MASIWRPGKGVFMKDIGKGRFIFQFFHELDLKRVYEGGPWAFGNFPLILHRLRKGEFPLTVPLDILPFWVQIHDLLAGFLTEGVGKLLGNFIGTFMEYDSTNSSGVWRQYMRVRVGIRVTDPLKRFKKLKQKDGSTFTVNFKYERLNVFCFLCGRLGHSESFCELMFNEGSKDTVREWVLALKRRIDGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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