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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001435`

染色体: Chr08 坐标: 11496642-11497746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001435`
名称	SmilChr08G001435
描述	glycine-rich RNA-binding protein-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11496642 - 11497746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000985`
GeneID	`131000985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000985`
原始查询	`SmilChr08G001435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycine-rich RNA-binding protein-like
产物	glycine-rich RNA-binding protein-like
Arabidopsis	`AT4G39260` (CCR1) cold, circadian rhythm, and RNA binding 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830082] identity=81.1; qcov=0.542; evalue=2.83e-49; confidence=medium
Rice	`Os12g0632000` (GRP162) - identity=83.2; qcov=0.536; evalue=5.12e-50; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783122.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783122.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057783122.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057783122.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057783122.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11496889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:11496958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B30,B63,B94
`Chr8:11497019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B40
`Chr8:11497020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B61,B8
`Chr8:11497028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C62
`Chr8:11497029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,B8
`Chr8:11497032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,C16,C48
`Chr8:11497037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:11497042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr8:11497050`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A1,A3,A4,A6,B10,B107,B108,B112,B117,B13,B131,B133,B135,B138,B26,B3,B35,B40,B42,B45,B54,B69,B71,B73,B8,B80,B92,B95,C1,C16,C20,C22,C23,C28,C30,C39,C4,C47,C48,C51,C64,C71,C74,C76,C78,C87,D10,D11
`Chr8:11497093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B122
`Chr8:11497105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B131,B46,B53,B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783122.1

166 aa

166

RRM_1

PF00076 RRM_1 11-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783122.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	11	80	4.2e-24	84.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927139.1
AACCTCAACCACTCCCTAACCTAGCTGTATTAACCAATATAAATACCCATACACTCCATCGCCACAATCATCAGTTCAGCATTTCAGTCCCTTCTCCTTAATTCTCTTCTCTTTCTCTAAAAATCAATGGCGTCTGCCGACGTTGAGTATAGGTGTTTCGTTGGTGGTTTGGCATGGGCCACCACCGATCAGTCGCTCGGTCAGGCCTTCTCTCAATTTGGCGAGGTCATCGAATCGAAGATTGTCAACGATCGCGAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000985
ATGGCGTCTGCCGACGTTGAGTATAGGTGTTTCGTTGGTGGTTTGGCATGGGCCACCACCGATCAGTCGCTCGGTCAGGCCTTCTCTCAATTTGGCGAGGTCATCGAATCGAAGATTGTCAACGATCGCGAGACCGGTAGATCGAGAGGATTCGGTTTCGTGACATTCAAGGATGAGCAGTCCATGAGGGACGCGATCGAGGGGATGAACGGACAGGAATTGGACGGCCGTAATATCACCGTCAACGAGGCTCAGTCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783122.1
MASADVEYRCFVGGLAWATTDQSLGQAFSQFGEVIESKIVNDRETGRSRGFGFVTFKDEQSMRDAIEGMNGQELDGRNITVNEAQSRGSGGGGGGGFRGPRREGGGGYGGSGGGGGGYGRREGGGGYGGGGGGGYGRREGGYGGGRGGGYGGDRSYGGASEGDWRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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