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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001439`

染色体: Chr08 坐标: 11543742-11549729 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001439`
名称	SmilChr08G001439
描述	uncharacterized SmilChr08G001439
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11543742 - 11549729 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000990`
GeneID	`131000990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000990`
原始查询	`SmilChr08G001439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FkbM family methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817209]; symbol=AT2G26680; hit=AT2G26680; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FkbM family methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817209]; symbol=AT2G26680; hit=AT2G26680; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G26680` (AT2G26680) FkbM family methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817209] identity=65.2; qcov=0.994; evalue=9.54e-155; confidence=high
Rice	`Os03g0566600` (OSJNBa0026A15.13) - identity=71.6; qcov=0.822; evalue=5.08e-141; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05050 (Methyltransf_21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057783126.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057783126.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783126.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783126.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11544099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr8:11544207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,D4
`Chr8:11544213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B112,B138,B37
`Chr8:11544282`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:11544282`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr8:11544315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:11544318`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A1,A23,B105,B110,B118,B7
`Chr8:11544570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B15,B2,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783126.1

321 aa

160

321

Methyltransf_21

PF05050 Methyltransf_21 138-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783126.1`	Pfam	`PF05050`	Methyltransf_21	Domain	138	306	2.1e-18	67.8	Methyltransferase FkbM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093834.1
TGAAGCTAGATTAGGATGACGAGCATAAAATTGTTGAGCTCGAACAAGCTCCGAGTCCGGGAAACCACTCGAGATCGACAACATTTTGAATTTATACGGGTTTTTCCTCAAATTAATTGAGAATAGTTCAAGTACTTATTGAATTAATTAATCAAGTATTAGGATGCTAGTGTAGTGATTAGTATCCATTTCGATTGTGCTCATCTCTCCCTTCCCCGCAAGATCCAGCTTGTAATTTGCAGAGATTCATGGCGAATGCG...

XR_009093835.1
ACGAGCATAAAATTGTTGAGCTCGAACAAGCTCCGAGTCCGGGAAACCACTCGAGATCGACAACATTTTGAATTTATACGGGTTTTTCCTCAAATTAATTGAGAATAGTTCAAGTACTTATTGAATTAATTAATCAAGTATTAGGATGCTAGTGTAGTGATTAGTATCCATTTCGATTGTGCTCATCTCTCCCTTCCCCGCAAGATCCAGCTTGTAATTTGCAGAGATTCATGGCGAATGCGTGGAGACGAAACCAGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000990
ATGGCGAATGCGTGGAGACGAAACCAGTCCACCAAAATCCTGACCCCCAAAAACCTCGTTCTCTTCATCTCCACCTCCCTCCTCCTCCTCATCTTCCTCCACCTCTCCTCCCAAACTCCCACCAGAAATCCTAGCACCAAATCCATCAAAGATTCAATTTCGCAGCGGGCCATCAAGCCCTTCGATTGCCTCGCGGCCCCACAGGCCCACCCCGTCGTGGCCAACACCGTGGAGGGCCTCAAGTTCCCCTTCCTCTACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783126.1
MANAWRRNQSTKILTPKNLVLFISTSLLLLIFLHLSSQTPTRNPSTKSIKDSISQRAIKPFDCLAAPQAHPVVANTVEGLKFPFLYSLSDFGTLPDKPHKNIVRTLKGKPFRRPDISATVQELLGEIKPRDREGVFVDVGANVGMASFAAAVMGFRVLAFEPVFENLQRICDGIYFNRVGDLVELFEAAASDSSGNITFHKLVGRLDNSAVSATGAKMAFKSNEEIAVQVRSIPLDEVIPVSERVLLLKIDVQGWEYHVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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