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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001443`

染色体: Chr08 坐标: 11572398-11575896 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001443`
名称	SmilChr08G001443
描述	protein IQ-DOMAIN 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11572398 - 11575896 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000994`
GeneID	`131000994`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000994`
原始查询	`SmilChr08G001443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 2-like
产物	protein IQ-DOMAIN 2-like
Arabidopsis	`AT5G03040` (iqd2) IQ-domain 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831696] identity=47.8; qcov=1.02; evalue=2.34e-127; confidence=high
Rice	`Os05g0123200` - identity=49.1; qcov=1.03; evalue=3.87e-117; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ); PF13178 (DUF4005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000994

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057783130.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057783130.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057783130.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057783130.1`
5	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057783130.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11572800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C14
`Chr8:11573131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr8:11573236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:11573888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:11574016`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A18,A2,A20,A24,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B103,B104,B108,B109,B113,B115,B121,B129,B132,B135,B138,B16,B18,B2,B21,B22,B25,B28,B31,B33,B38,B47,B52,B56,B58,B59,B61,B66,B67,B68,B70,B77,B84,B86,B87,B91,B94,B95,B96,B98,C11,C13,C16,C18,C23,C26,C29,C34,C35,C37,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C46,C51,C53,C55,C6,C60,C68,C69,C72,C8,C80,C81,C82,C85,C87,D10,D2
`Chr8:11574018`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	83	A18,A2,A20,A24,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B103,B104,B108,B109,B113,B115,B121,B129,B132,B135,B138,B16,B18,B2,B21,B22,B25,B28,B31,B33,B38,B47,B52,B56,B58,B59,B61,B66,B67,B68,B70,B77,B84,B86,B87,B91,B94,B95,B96,B98,C11,C13,C16,C18,C23,C26,C29,C34,C35,C37,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C46,C51,C53,C55,C6,C60,C68,C69,C72,C8,C80,C81,C82,C85,C87,D10,D2
`Chr8:11574643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B34
`Chr8:11574649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B90
`Chr8:11574776`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B52
`Chr8:11574776`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B52
`Chr8:11574788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783130.1

462 aa

231

462

DUF4005

PF00612 IQ 114-132 aa PF13178 DUF4005 377-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783130.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	114	132	9.1e-06	25.7	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057783130.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	377	442	1.4e-05	26.3	Protein of unknown function (DUF4005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927147.1
GAAAAAACCTTGTATTTAGCATAAACTTGTGATTAATACGTAATGGAAAAAAAAGTGTGCGTGGGTCCCAGGGTGGATAAACATAAACCAGTAGTGAAGGCTACTGTGAATTCTTATTTTAGTAATTAGTTATTATGCGTTTGTTGGTTGAATTGCTAAGATCTGCTCTCTCTGTCTTCCCAACTCCTCATACTCAATCGAGAAAGCTTCCACAACAGTTCAACGTCTTTCCTTTTGTGTGTTTCAAATTTCGTGTTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000994
ATGGCAAAAGGTAGTTGGTTTTCATCAGTAAAGAAGGCTCTAGGCCTGCGTTCCAAGAGATCAAGTAAATCAAAGAAGATATTGCTTGTGAATGAAATGCCATCAGCCTCTGATTTACCAAATCCAGAGAGTTTTGAAGTTTCTAATCCTCATCCACCTCCACAACTGGGAAACATGAGGTCGACGGAGTTGGAGAATGAGCAGACAAAGCATGCTCACTCCGTTGCAGTTGCTGCAGCTGTAGATACTGAAGTAGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783130.1
MAKGSWFSSVKKALGLRSKRSSKSKKILLVNEMPSASDLPNPESFEVSNPHPPPQLGNMRSTELENEQTKHAHSVAVAAAVDTEVEIAAVEATPEVVPLPTVTQVAGKHQEEVAALKIQTAFRGYLARRALRALRGLVRLKSLVDGPAAERQTSNTLKCLQTLSRLQSQIQSRRTRMLDESRAVQRQLLQRRVKELDSLRMAEEWDDSLQTKEETEASLLHKYEAAMRRERALAYSYTHQQTWKKSAKLNNLLFMDPTNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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