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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001447`

染色体: Chr08 坐标: 11648391-11651905 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001447`
名称	SmilChr08G001447
描述	SH3 domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11648391 - 11651905 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000997`
GeneID	`131000997`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000997`
原始查询	`SmilChr08G001447`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SH3 domain-containing protein 2-like
产物	SH3 domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G34660` (AT4G34660) SH3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829618] identity=75.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0512700` - identity=73.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00018 (SH3_1); PF07653 (SH3_2); PF14604 (SH3_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000997

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057783136.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783136.1`
3	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057783136.1`
4	Endosome	内体	1.00000	`XP_057783136.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783136.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11648855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C78
`Chr8:11649530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B35,C31
`Chr8:11650566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783136.1

368 aa

184

368

SH3_2

SH3_9

SH3_1

PF07653 SH3_2 306-354 aa PF14604 SH3_9 306-354 aa PF00018 SH3_1 308-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783136.1`	Pfam	`PF07653`	SH3_2	Domain	306	354	1e-08	35.4	Variant SH3 domain
`XP_057783136.1`	Pfam	`PF14604`	SH3_9	Domain	306	354	4.9e-10	39.8	Variant SH3 domain
`XP_057783136.1`	Pfam	`PF00018`	SH3_1	Domain	308	349	2.2e-08	34.3	SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927153.1
GTGTATGCATAGTACATAAGGATACGAAGTTCTGTAGACGGGTCTTCCAACGTTCTTCATTTTCAAACCCCTAAAGTCGTGTGTTCAATTCTTCTCACCAAACAATCCGAGCTTTACACGTTCATACCAATTCAAAAGCAATTGATCGGTTCGTCAATGGAAGCCATCAGAAAGCAAGCCTCCAGGCTAAGAGAGCAGGTCGCCAGGCAACAGCAGGCTGTCCTGAAGCAGTTTGGAGCATATGGAGGTTCGGATAATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000997
ATGGAAGCCATCAGAAAGCAAGCCTCCAGGCTAAGAGAGCAGGTCGCCAGGCAACAGCAGGCTGTCCTGAAGCAGTTTGGAGCATATGGAGGTTCGGATAATACATCAACTGATGATGCTGAGCTCCAACAACACCAGAAGCTCGAAAAACTATATATATCTACAAGAGCTGCTAAGCATTTCCAAAGGGACATTGTTCGTGGAGTTGAAGGTTACATTGTTACAGGATCTAAACAAGTTGAGATAGGAACTAAATTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783136.1
MEAIRKQASRLREQVARQQQAVLKQFGAYGGSDNTSTDDAELQQHQKLEKLYISTRAAKHFQRDIVRGVEGYIVTGSKQVEIGTKLSEDSRKYGVENTCTTGNTLSKAASNFSQARAQMEKEHGNLLKALGTQVAEPLRAMVMGAPLEDARHLAQRYDRMRQEGEAQAVEVARKQAKVREGAAHPDMAFKLEAAEAKLQDVKSNVATLGKEASAAMAAVEAQQQRLTLQRLITMVEAERAYHQRVLQILDQLEGEMMSER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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