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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001460`

染色体: Chr08 坐标: 11760158-11763958 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001460`
名称	SmilChr08G001460
描述	translocon-associated protein subunit alpha-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11760158 - 11763958 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001008`
GeneID	`131001008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001008`
原始查询	`SmilChr08G001460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	translocon-associated protein subunit alpha-like
产物	translocon-associated protein subunit alpha-like
Arabidopsis	`AT2G16595` (AT2G16595) Translocon-associated protein (TRAP), alpha subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816160] identity=52.6; qcov=0.902; evalue=3.18e-82; confidence=high
Rice	`Os06g0715500` - identity=65.4; qcov=0.929; evalue=2.36e-109; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03896 (TRAP_alpha)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057783152.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057783152.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783152.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783152.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783152.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11760703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:11761385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:11761409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:11761646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:11762692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,C62,C74,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783152.1

255 aa

128

255

TRAP_alpha

PF03896 TRAP_alpha 76-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783152.1`	Pfam	`PF03896`	TRAP_alpha	Family	76	238	3.3e-13	50.0	Translocon-associated protein (TRAP), alpha subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927169.1
TACTTTTATCTGGCTTAAAAACTGATTTCCCCGTTTTGGCCTTTTCATTAGTGTTTACTACAGGCGTTAAAAAGTTCAATTTCAGCTGCCTTCACTCAAAACGGTTCCTTTTCTCTTTAGTGTTCGGACAGGTAAAGAATCGAAAATGACAATTAGGGTTTTTCTGATCCTAACTCTATTACTATTCTCCTCCTCTTTTATGCAAATTGCAAGATGTGAACTGGATCCTGATGCGGATGCTGATTCCCGTGAGGATGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001008
ATGACAATTAGGGTTTTTCTGATCCTAACTCTATTACTATTCTCCTCCTCTTTTATGCAAATTGCAAGATGTGAACTGGATCCTGATGCGGATGCTGATTCCCGTGAGGATGGAGGGGATCTTGGGACTGTTGGTGATGATATCCAAGATTTTAGTGGAGGAAGCTTTAGTCCAGCTGCAGGGGTGGAAACCATATGTGTTTTCCCCAAAAATCCCTCAAAATCTATAGCAGCAGGAGAAGAAAGTGAACTTCTTGTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783152.1
MTIRVFLILTLLLFSSSFMQIARCELDPDADADSREDGGDLGTVGDDIQDFSGGSFSPAAGVETICVFPKNPSKSIAAGEESELLVGIGNGGESSINVIAIQATVYLPFDHRYLIQNLSAQAFNNASVPPSAQATFPYIFAVSKFLQSGEYDLVGTIVYEIDQNPYQSTFYNGTIEVTEVGGLLSVESVFLFCLAVALLGLLGIWIRGQIQNFSKKTKRVAKVEVGTGTTDADMDEWLQGTAYTQSQSNKSKKKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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