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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001461`

染色体: Chr08 坐标: 11768597-11771797 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001461`
名称	SmilChr08G001461
描述	transcription factor bHLH121
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	11768597 - 11771797 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001009`
GeneID	`131001009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001009`
原始查询	`SmilChr08G001461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH121
产物	transcription factor bHLH121
Arabidopsis	`AT3G19860` (bHLH121) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821523] identity=58.8; qcov=0.99; evalue=1e-95; confidence=high
Rice	`Os02g0433600` (OsbHLH064) - identity=50.2; qcov=1.06; evalue=3.35e-83; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783153.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783153.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783153.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783153.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783153.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:11769639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B25
`Chr8:11770472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C75
`Chr8:11770735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C46
`Chr8:11770789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:11770966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C14,D6
`Chr8:11771040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:11771089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783153.1

323 aa

162

323

HLH

bHLH_IRO3

PF00010 HLH 43-93 aa PF23177 bHLH_IRO3 44-130 aa

XP_057783154.1

292 aa

146

292

HLH

bHLH_IRO3

PF00010 HLH 12-62 aa PF23177 bHLH_IRO3 13-99 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783153.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	43	93	6.5e-10	39.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057783153.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	44	130	2e-27	96.1	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain
`XP_057783154.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	12	62	5.6e-10	39.6	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057783154.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	13	99	1.7e-27	96.3	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093841.1
ATGAATATGTGATAACGCCATACCCCACTCTTCTCCGGCCCAGCTTAGCTGCGATGCGATGTCGTCTCGGCATAGCACTGCCGCCTAAATCCTCACCTTCTGCAAATTCTCTAAATCTCACACCACTATCTGAATAATTTATCCTCTTTCCACTATGGATCAACTCAATCCCAACTCGCTTTTTCTGCCCGCGCCTGATGCGTGCGTCCCGCCGACTGGCCCGACTCGCCCCAATCCCGATTGTAGAATGGAACCAGAAA...

XM_057927170.1
GTATTGAACAAGTGGATGGCAACCGTATGAATATGTGATAACGCCATACCCCACTCTTCTCCGGCCCAGCTTAGCTGCGATGCGATGTCGTCTCGGCATAGCACTGCCGCCTAAATCCTCACCTTCTGCAAATTCTCTAAATCTCACACCACTATCTGAATAATTTATCCTCTTTCCACTATGGATCAACTCAATCCCAACTCGCTTTTTCTGCCCGCGCCTGATGCGTGCGTCCCGCCGACTGGCCCGACTCGCCCCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001009
ATGGATCAACTCAATCCCAACTCGCTTTTTCTGCCCGCGCCTGATGCGTGCGTCCCGCCGACTGGCCCGACTCGCCCCAATCCCGATTGTAGAATGGAACCAGAAACAAAGGACACTGTAAGTGCTCGGAGAGTTCAAAAAGCTGATCGTGAGAAGTTGAGGAGGGATCGTCTCAATGAACAATTCATGGAGCTGGGGAACGCCCTCGATCCCGATAGACCTAAAAATGACAAAGCCTCTATTCTTTCGGATACGATTCA...

LOC131001009
ATGGAACCAGAAACAAAGGACACTGTAAGTGCTCGGAGAGTTCAAAAAGCTGATCGTGAGAAGTTGAGGAGGGATCGTCTCAATGAACAATTCATGGAGCTGGGGAACGCCCTCGATCCCGATAGACCTAAAAATGACAAAGCCTCTATTCTTTCGGATACGATTCAAATGCTCAAGGATTTGACTGCTCAGGTTGAAAAACTAAAATCTGAGTATGCTGCACTCACTGATGAGTCACGTGAGCTGACCCAGGAAAAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783153.1
MDQLNPNSLFLPAPDACVPPTGPTRPNPDCRMEPETKDTVSARRVQKADREKLRRDRLNEQFMELGNALDPDRPKNDKASILSDTIQMLKDLTAQVEKLKSEYAALTDESRELTQEKNDLREEKASLKSDIENLNGQYLQRVRAMYPWAGMDHSVVMHPSSYPFPMPVPVPTGPIPLHPSLQPYPFYGNQNPAVVPNPCSTYVPYMTHNPMIEQQSTQHVSQVMQQGTRPHASTKQDPRNKSSDVESRIEKSDDSNDITT...

XP_057783154.1
MEPETKDTVSARRVQKADREKLRRDRLNEQFMELGNALDPDRPKNDKASILSDTIQMLKDLTAQVEKLKSEYAALTDESRELTQEKNDLREEKASLKSDIENLNGQYLQRVRAMYPWAGMDHSVVMHPSSYPFPMPVPVPTGPIPLHPSLQPYPFYGNQNPAVVPNPCSTYVPYMTHNPMIEQQSTQHVSQVMQQGTRPHASTKQDPRNKSSDVESRIEKSDDSNDITTDLELKTPGSTSEQDSSSKQRRAKRVVRKETS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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