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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001493`

染色体: Chr08 坐标: 12078565-12082612 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001493`
名称	SmilChr08G001493
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP21-1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12078565 - 12082612 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001042`
GeneID	`131001042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001042`
原始查询	`SmilChr08G001493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP21-1-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP21-1-like
Arabidopsis	`AT4G34960` (AT4G34960) Cyclophilin-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829648] identity=61.9; qcov=1.07; evalue=5.73e-87; confidence=high
Rice	`Os09g0537600` (OsCYP21-1) - identity=67.6; qcov=0.848; evalue=2.76e-81; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0006457 (protein folding); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057783196.1`
2	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.40000	`XP_057783196.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057783196.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783196.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783196.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12081773`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B24
`Chr8:12081773`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B24
`Chr8:12081792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr8:12082317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C36,C38,C55,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783196.1

220 aa

110

220

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 54-213 aa

XP_057783197.1

204 aa

102

204

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 59-197 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783196.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	54	213	7.3e-49	166.8	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD
`XP_057783197.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	59	197	7.7e-42	143.9	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927214.1
ATTTCAGAAATTATCAATTTTCAAATCGCCTTAAATCTCGAGCGATAATTAATAGTGCTTGCAACGGCAATAACCTGTCGTATCGTATCTACCATTTCTGTGGCCTTGATTCGAGAGAAAATTATATTTTCGACCACTTCATCAATTTATTTGTCGATTCAATCGTATTAATTGCTCTGACGAGTGAGAATTCAGGTTTCTGTTCAGGCAGCGGAGAATGGTACTTAACTAGTGAAATCGGCAGTTGTTTGTAGTGGAGA...

XM_057927213.1
CAGAAATTATCAATTTTCAAATCGCCTTAAATCTCGAGCGATAATTAATAGTGCTTGCAACGGCAATAACCTGTCGTATCGTATCTACCATTTCTGTGGCCTTGATTCGAGAGAAAATTATATTTTCGACCACTTCATCAATTTATTTGTCGATTCAATCGTATTAATTGCTCTGACGAGTGAGAATTCAGGTTTCTGTTCAGGCAGCGGAGAATGGTACTTAACTAGTGAAATCGGCAGTTGTTTGTAGTGGAGAATAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001042
ATGAGGCGAGATATCTCAGTGTTGCTTCAGCCGAAAATTTTGCTTCTTTTCGTTGTGGCTTTGGTTCTCATCTTTCTCGTTCTTTCATTTTCTCCCCAGCCCCAGGAGGTTGAGAGACCGGAGGAGGTATATGAAATCACTCGTAGAGTATTTTTGGATGTTGACATAGACAAGCAACATGCAGGACGGATAACCATAGGATTATATGGTCAAGTTGTGCCAAAGACTGTAGAGAATTTCAGGGCTTTGTGTACAGGGAA...

LOC131001042
ATGAGGCGAGATATCTCAGTGTTGCTTCAGCCGAAAATTTTGCTTCTTTTCGTTGTGGCTTTGGTTCTCATCTTTCTCGTTCTTTCATTTTCTCCCCAGCCCCAGGAGGTTGAGAGACCGGAGGAGGTATATGAAATCACTCGTAGAGTATTTTTGGATGTTGACATAGACAAGCAACATGCAGAGAATTTCAGGGCTTTGTGTACAGGGAAGATGGGAAAAGCCCCCAACGGAAAAGTTCTACACTACAAGGGAACTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783196.1
MRRDISVLLQPKILLLFVVALVLIFLVLSFSPQPQEVERPEEVYEITRRVFLDVDIDKQHAGRITIGLYGQVVPKTVENFRALCTGKMGKAPNGKVLHYKGTPFHRIIPGFMIQGGDIVSGDGRGNQSIYGGTFRDENFKLKHSHAGVVSMVNSGPDSNGSQFFITTVKTYWLDGEHVVFGKVIDGMDTVYAIEGGAGTYSGNPRKKVIIVDSGELSKGE

XP_057783197.1
MRRDISVLLQPKILLLFVVALVLIFLVLSFSPQPQEVERPEEVYEITRRVFLDVDIDKQHAENFRALCTGKMGKAPNGKVLHYKGTPFHRIIPGFMIQGGDIVSGDGRGNQSIYGGTFRDENFKLKHSHAGVVSMVNSGPDSNGSQFFITTVKTYWLDGEHVVFGKVIDGMDTVYAIEGGAGTYSGNPRKKVIIVDSGELSKGE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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