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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001496`

染色体: Chr08 坐标: 12132208-12133332 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001496`
名称	SmilChr08G001496
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12132208 - 12133332 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998081`
GeneID	`130998081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998081`
原始查询	`SmilChr08G001496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3
Arabidopsis	`AT1G34300` (AT1G34300) lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840330] identity=45.5; qcov=0.794; evalue=6.46e-87; confidence=high
Rice	`Os04g0475200` - identity=50.3; qcov=1.02; evalue=5.2e-133; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779497.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779497.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779497.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779497.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12132240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,C19,D1,D8
`Chr8:12132431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A14,A19,A5,B10,B109,B129,B13,B17,B28,B34,B73,B79,B83,B85,C12,C13,C20,C58,C6,C83
`Chr8:12132453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr8:12132508`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B126,B41,C31
`Chr8:12132508`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B126,B41,C31
`Chr8:12132559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C58
`Chr8:12132663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C73,D6
`Chr8:12132895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr8:12133198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B13,B80,D11,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779497.1

374 aa

187

374

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 89-355 aa PF00069 Pkinase 90-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779497.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	89	355	2.6e-45	155.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057779497.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	90	354	2.6e-48	165.4	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923514.1
ATGATCAAGCTCAGGAGAAACCACACTACAATATCGAATCCCAACAACCCTGATTCTGCCTGCGGCAAGAGCAGCACCTCATCCACTAATCTCATCATAGCATTGTCGGTCTTATTAGGCTCTTCACTGTTACTGCTTCTTGCTACGTCTGCCTTCTTCCTATTCTATTCCAAATACAGAAAATCTGCAGTGGTTTGTCCAGCTGGAGGAGTGAACGTGATGCCCAGCTTCAGTTTCAAGGAGCTGCAAGAAGCTACCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998081
ATGATCAAGCTCAGGAGAAACCACACTACAATATCGAATCCCAACAACCCTGATTCTGCCTGCGGCAAGAGCAGCACCTCATCCACTAATCTCATCATAGCATTGTCGGTCTTATTAGGCTCTTCACTGTTACTGCTTCTTGCTACGTCTGCCTTCTTCCTATTCTATTCCAAATACAGAAAATCTGCAGTGGTTTGTCCAGCTGGAGGAGTGAACGTGATGCCCAGCTTCAGTTTCAAGGAGCTGCAAGAAGCTACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779497.1
MIKLRRNHTTISNPNNPDSACGKSSTSSTNLIIALSVLLGSSLLLLLATSAFFLFYSKYRKSAVVCPAGGVNVMPSFSFKELQEATDEFKDELGRGACSIVYRGALKDGRVVAVKKLDKMAEDADGEFIAEVSSISKTNHKNLMSLLGYCDQGQHRILVYEFMTNGSLATFLFQKSARPNWYTRLQIAFSIARGLCYLHEDCSAPIIHCDIKPQNVLLDESFTPKIADFGLAKLMKPDQTRTITGIRGTRGYVAPEWFRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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