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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001503`

染色体: Chr08 坐标: 12180097-12181404 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001503`
名称	SmilChr08G001503
描述	MYB-like transcription factor 4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12180097 - 12181404 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001051`
GeneID	`131001051`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001051`
原始查询	`SmilChr08G001503`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmMYB39` CORE-065; 2013	`KC213793`	`LOC131001051` `SmilChr08G001503` GeneID 131001051	nucleotide CDS and protein BLAST against active nuclear reference, 2026-09-27; identity 98.413%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MYB-like transcription factor 4
产物	MYB-like transcription factor 4
Arabidopsis	`AT4G38620` (MYB4) myb domain protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830018] identity=60.4; qcov=1.23; evalue=1.64e-107; confidence=high
Rice	`Os09g0538400` (R2R3-MYB) - identity=64.6; qcov=1.13; evalue=4.93e-115; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001051

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783206.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783206.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783206.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783206.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783206.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12180279`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B109
`Chr8:12180279`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B109
`Chr8:12180280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B79,C36
`Chr8:12180282`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	108	A16,A20,A23,A24,A9,B102,B103,B106,B108,B110,B111,B118,B119,B12,B128,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B139,B140,B16,B17,B18,B23,B26,B27,B29,B30,B31,B34,B36,B37,B38,B4,B44,B46,B48,B50,B51,B62,B63,B65,B75,B76,B78,B79,B80,B83,B86,B88,B89,B93,B95,B97,B98,C1,C10,C11,C14,C15,C16,C19,C22,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C36,C41,C44,C45,C46,C5,C52,C54,C55,C56,C57,C6,C64,C66,C67,C70,C74,C75,C79,C80,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D4,D6,D7,D8
`Chr8:12180345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B98
`Chr8:12180413`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B80,C3
`Chr8:12180413`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B80,C3
`Chr8:12180414`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A8,B110,B25,B31,B60,B86,B9,B99,C10,C75,C87
`Chr8:12180416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B53
`Chr8:12180427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C3
`Chr8:12180468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D11
`Chr8:12180531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B76,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783206.1

230 aa

115

230

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-75 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-111 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783206.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	1.7e-37	128.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057783206.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	75	1.4e-22	80.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057783206.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	111	1.7e-37	128.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057783206.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	115	1.4e-22	80.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927223.1
ATGATAATGTTGTCGTACTATAATTGAAATTGATGATGTTCATATCACCATGAGATGCCACCACCCACTTTCTCTCTCTCTCTCTAACCTTTCCCACCAACTCACATCTAGAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTAGAGTCAAAAGCTTTATATATAAGGCCACACCAAGTACTCCATGAAGGGCCGGCCTTGATGCTCAAGCACCACCAAGGTTAGGCTTTGATATATACAAGTACTAGTGTCAATTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001051
ATGGGAAGGTCTCCTTGCTGTGAGAAAGCTCACACAAACAAAGGGGCGTGGACTAAGGAAGAAGACGATCGGCTGGTGGCCTACATCCGCGCCCACGGCGAGGGATGCTGGCGCTCGCTCCCTAAGGCCGCCGGGCTCCTCCGCTGCGGCAAGAGCTGCCGCCTCCGCTGGATCAACTACCTCCGCCCCGATCTCAAGAGAGGCAACTTCACCGAAGAAGAAGACGAACTCATCATCAAACTCCATAGCCTTCTCGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783206.1
MGRSPCCEKAHTNKGAWTKEEDDRLVAYIRAHGEGCWRSLPKAAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGNFTEEEDELIIKLHSLLGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIRRKLVSRGIDPTTHRPINEAEAQPATTISFNSSNKLLEKEERCSPKCPDLNLDLRISPPYQQEPFKTGTSSRSSTLCFACSLGIQNSKDCSCTNTTNSGFDFLGLKSGVLDYRRLEMK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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