当前解析结果
SmilChr08G001506| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001506 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001506 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001506 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 12195929 - 12199148 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998084 |
|---|---|
| GeneID | 130998084 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998084 |
| 原始查询 | SmilChr08G001506 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998084 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779500.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057779500.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779500.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779500.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779500.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:12196279 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr8:12197564 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 32 | A10,A18,A2,A8,B102,B106,B107,B115,B118,B119,B120,B130,B140,B42,B43,B47,B6,B60,B75,B82,B84,B85,B87,C19,C28,C45,C47,C49,C60,C67,C80,C82 |
Chr8:12197732 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,C49 |
Chr8:12197766 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,B70 |
Chr8:12197820 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,B80 |
Chr8:12197851 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B119,B64,C38 |
Chr8:12197859 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B103,B61 |
Chr8:12197859 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B103,B61 |
Chr8:12197943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C55 |
Chr8:12197975 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:12197984 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A13,A21,B104,B108,B114,B128,B22,B53,B68,B70,B71,B88,C18,C59,C64,C66 |
Chr8:12197994 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,C49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。