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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001512`

染色体: Chr08 坐标: 12276356-12277775 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001512`
名称	SmilChr08G001512
描述	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12276356 - 12277775 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001058`
GeneID	`131001058`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001058`
原始查询	`SmilChr08G001512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 2
产物	probable BOI-related E3 ubiquitin-protein ligase 2
Arabidopsis	`AT4G35070` (AT4G35070) SBP (S-ribonuclease binding protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829659] identity=37.5; qcov=1.11; evalue=3.92e-49; confidence=medium
Rice	`Os04g0402500` - identity=29.4; qcov=0.779; evalue=1.49e-28; confidence=low
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001058

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783219.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783219.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783219.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783219.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783219.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12276935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C45,C61
`Chr8:12277354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:12277375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B19,B30,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783219.1

253 aa

126

253

zf-C3HC4_3

PF13920 zf-C3HC4_3 204-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783219.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	204	244	1.6e-07	31.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927236.1
ATATCTCGTGTGGGCTGACCCTCAAATCTAGAAAAACTTGAATTGAATAACTCCTCATTCAACAACGCTCCGCTCTGAAACCTCTGATCCGATAGTTTAGTCACAAAAATTGCATGTGTACGCCCTTTTGCTTAGCCATCCTTCTTTAATGCATCACAAGAGAAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGGCCCCCACCAATTCCTTTGTTTTTCTTTTCCTTTTTAAGTTTTTTTCAGTTACCTTTATTTATTTTGATTGTTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001058
ATGGCCATTCAAGCACACTTGTTTTCGGAGAATCTAGGTTTTCCGCTCGGAAATTCTCAGGATAATTTGTTGGTGGAAAATGGTTGTGGATTCGATAATCTGTGTTTCGCCCCCCAACAATTCATTCAGTTGGATCAGTTTCAGAATTCGTTAGTTGATAACAACGCTCAATTTCATCAACACCAATTTATGACCTTTTCGCAGAGCGTTTCGTCGCATATCGAGAGGCAGAGGTTCGAATTCGACAACTTCGTTAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783219.1
MAIQAHLFSENLGFPLGNSQDNLLVENGCGFDNLCFAPQQFIQLDQFQNSLVDNNAQFHQHQFMTFSQSVSSHIERQRFEFDNFVNLQNERLRMAMQEQRKQQIAVLMKKYEWKTELLLKQKDEEIAKAANRTTELHNFMKRMEMENQTWQRAAKENEAMIASLNSSIQRLRESAYLSENAAEDAESCCQNMERIQQNTEINKKMVCRCCNSRNSCVVMLPCRHLCSCKDCEVFLDSCPVCSMAKKAAIEALI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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