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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001525`

染色体: Chr08 坐标: 12399147-12402375 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001525`
名称	SmilChr08G001525
描述	imidazoleglycerol-phosphate dehydratase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12399147 - 12402375 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001068`
GeneID	`131001068`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001068`
原始查询	`SmilChr08G001525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	imidazoleglycerol-phosphate dehydratase, chloroplastic-like
产物	imidazoleglycerol-phosphate dehydratase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G14910` (HISN5B) HISTIDINE BIOSYNTHESIS 5B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827149] identity=81.2; qcov=1.02; evalue=6.06e-132; confidence=high
Rice	`Os04g0617800` (STS22) - identity=83.4; qcov=0.959; evalue=3.73e-124; confidence=high
GO	GO:0000105 (L-histidine biosynthetic process); GO:0004424 (imidazoleglycerol-phosphate dehydratase activity)
KEGG	smil00340 (Histidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00475 (IGPD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001068

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783239.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057783237.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057783238.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783239.1`
5	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057783239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12399684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:12401915`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B122,B19,B30,C64,C66,C8
`Chr8:12402046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783237.1

284 aa

142

284

IGPD

PF00475 IGPD 106-249 aa

XP_057783238.1

273 aa

136

273

IGPD

PF00475 IGPD 106-249 aa

XP_057783239.1

231 aa

116

231

IGPD

PF00475 IGPD 53-196 aa

XP_057783240.1

220 aa

110

220

IGPD

PF00475 IGPD 53-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783237.1`	Pfam	`PF00475`	IGPD	Family	106	249	8.4e-64	214.7	Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
`XP_057783238.1`	Pfam	`PF00475`	IGPD	Family	106	249	7.5e-64	214.9	Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
`XP_057783239.1`	Pfam	`PF00475`	IGPD	Family	53	196	4.8e-64	215.5	Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase
`XP_057783240.1`	Pfam	`PF00475`	IGPD	Family	53	196	3.5e-64	216.0	Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927255.1
GAAGAAATAGACCATTATTTATGGGACGGAGGGAGTAAGTCATTACTGAAAGTGCGACTACATTTTAAAACATTAAAACGTGAAACCTAACTCTATATCCCTCCCGCCGCGAACAAACCACCAGTCGCCGCCACTCTCCGCCGTCCATTCCGCTCAGGTTCCTCCACGTATGGAACTCTCAATCCCTCACCGTTCCCTCATCCATTCCAATTTCTCTCACTCGCTCCTTCGTAACTCACCTGTTCATCCCTCGCAGCGTC...

XM_057927256.1
ACGGAGGGAGTAAGTCATTACTGAAAGTGCGACTACATTTTAAAACATTAAAACGTGAAACCTAACTCTATATCCCTCCCGCCGCGAACAAACCACCAGTCGCCGCCACTCTCCGCCGTCCATTCCGCTCAGGTTCCTCCACCGTCTTCTCCTCCCCGTACACCTTCCGCAGCGCAAGGTACACATCCTCTCCACTCACCTTCCATCTTCTTCAATGGATCCCGTGGTCACTCGCGCGTCCGACAACAACGGCTCGCCGG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131001068
ATGGAACTCTCAATCCCTCACCGTTCCCTCATCCATTCCAATTTCTCTCACTCGCTCCTTCGTAACTCACCTGTTCATCCCTCGCAGCGTCTTCTCCTCCCCGTACACCTTCCGCAGCGCAAGGTACACATCCTCTCCACTCACCTTCCATCTTCTTCAATGGATCCCGTGGTCACTCGCGCGTCCGACAACAACGGCTCGCCGGCGGTAACTACAGTTCAAGGAGGAAGAATTGGAGAGGTTAAGAGGGTTACGAAGGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057783237.1
MELSIPHRSLIHSNFSHSLLRNSPVHPSQRLLLPVHLPQRKVHILSTHLPSSSMDPVVTRASDNNGSPAVTTVQGGRIGEVKRVTKETNVSVKINLDGDAVAENNTGIPFLDHMLDQLASHGLFDVHVKAVGDIHIDDHHTNEDVALAIGTAMLQALGDRKGINRFGDFSAPLDEALVHVSLDLSGRPHLGYDLHIPTERVGTYDTQLVEHFFQSLVNTSGMTLHIRQLAGKNSHHIIEATFKAFARALRQATEYDPRRR...

XP_057783238.1
MELSIPHRSLIHSNFSHSLLRNSPVHPSQRLLLPVHLPQRKVHILSTHLPSSSMDPVVTRASDNNGSPAVTTVQGGRIGEVKRVTKETNVSVKINLDGDAVAENNTGIPFLDHMLDQLASHGLFDVHVKAVGDIHIDDHHTNEDVALAIGTAMLQALGDRKGINRFGDFSAPLDEALVHVSLDLSGRPHLGYDLHIPTERVGTYDTQLVEHFFQSLVNTSGMTLHIRQLAGKNSHHIIEATFKAFARALRQATEYDPRRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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