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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001527`

染色体: Chr08 坐标: 12437648-12441215 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001527`
名称	SmilChr08G001527
描述	FRIGIDA-like protein 4a
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12437648 - 12441215 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001071`
GeneID	`131001071`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001071`
原始查询	`SmilChr08G001527`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FRIGIDA-like protein 4a
产物	FRIGIDA-like protein 4a
Arabidopsis	`AT3G22440` (AT3G22440) FRIGIDA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821815] identity=65.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0173200` (P0496D04.37-1) - identity=44.1; qcov=1.02; evalue=8.55e-139; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07899 (Frigida)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001071

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783242.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783242.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783242.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783242.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783242.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12438137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B118,B120,C41,C79
`Chr8:12438148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B51,B61
`Chr8:12438350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B98,C45
`Chr8:12438371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:12438512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B64,C10,C38
`Chr8:12438596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:12440153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B30,C64,C66
`Chr8:12440208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr8:12440264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:12440630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:12440678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:12440793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783242.1

517 aa

258

517

Frigida

PF07899 Frigida 120-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783242.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	120	404	5e-102	341.8	Frigida-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927259.1
GTTAGCCTCGACCAGCTGAACACATTAGTTTTACCCGACAACCCACACCTGTCTCCCTCACAGTCCGCCACATCATCAGACTCCGTACTCCCCCCCTCTCTCTCTACCTCAACTTTATCTTCCCTACCACCAGCACTTTCTCACTCCTCTTTCTCTCTCTCTAGAATTTCCTTAGGGTTTAATTTCGAACCGACTTCTCTGACTCGACCTCCAAATTGATTATCGCACCTCTCTCGCAATGGGCTCGCTACCCGATCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001071
ATGGGCTCGCTACCCGATCCGGGCGAGTTGACTCACCCCCCGCCGCCGAGTTTCGACGATTTCCAGAGGCAGACGTCGCTGATGACGAGCTGCACTCTCCTCTGGAAGGAGCTCTCCGACCACTTCACCACTCTGGAGCAGGACCTTATCAAGAAATCAGACGCACTCAAGGCGAAGGTGGAAGCCTTAAACCAGGAGACGCAGCAGTCGCTCAAGGCCCTCGACTCGCGCGAGTCGTCCATCTCGAGATCGATCTCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783242.1
MGSLPDPGELTHPPPPSFDDFQRQTSLMTSCTLLWKELSDHFTTLEQDLIKKSDALKAKVEALNQETQQSLKALDSRESSISRSISIAYETLEQATKMSISFSGDDTAEEEAEVDDSEGLLMKLRGFCRRMAAKEFWIFVTSRKKELELFRSELPKALSSCVDPPRFVLEAISEVFPVASSASHSYDLGWACVLLLESLIPGMVDPVLGKERMLVTPSIKGKAEEIAEAWKKSLEERGGIENVKTPDVHTFLQHLVTFGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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