当前解析结果
SmilChr08G001535| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001535 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001535 |
| 描述 | zinc finger protein 6-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 12476025 - 12476725 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001081 |
|---|---|
| GeneID | 131001081 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001081 |
| 原始查询 | SmilChr08G001535 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | zinc finger protein 6-like |
| 产物 | zinc finger protein 6-like |
| Arabidopsis | AT5G43540 (AT5G43540)C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834374] identity=39.8; qcov=0.831; evalue=7.25e-16; confidence=low |
| Rice | Os07g0417400- identity=78.1; qcov=0.235; evalue=4.57e-13; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001081 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057783256.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783256.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783256.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057783256.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057783256.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:12476385 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B24 |
Chr8:12476385 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B24 |
Chr8:12476538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,B1,B72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。