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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001536`

染色体: Chr08 坐标: 12481639-12483672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001536`
名称	SmilChr08G001536
描述	uncharacterized SmilChr08G001536
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12481639 - 12483672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998088`
GeneID	`130998088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998088`
原始查询	`SmilChr08G001536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=24.3; qcov=0.746; evalue=3.97e-37; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=31.8; qcov=0.738; evalue=4.02e-71; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779504.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779504.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779504.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779504.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12481708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B49,B53,C73,D6
`Chr8:12481717`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr8:12481717`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr8:12481726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B24,B4
`Chr8:12481813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:12481906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:12482114`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr8:12482145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:12482170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:12482175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:12482215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B1,B72
`Chr8:12482216`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779504.1

558 aa

279

558

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 241-336 aa PF00872 Transposase_mut 258-412 aa PF04434 SWIM 479-517 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779504.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	241	336	2.5e-13	50.9	MULE transposase domain
`XP_057779504.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	258	412	1.3e-05	25.1	Transposase, Mutator family
`XP_057779504.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	479	517	1e-06	28.8	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923521.1
ATGACTGAAAAGAAGGTTAATGAAAATGATAGTGAGAAGGTTAGTGAGAGGCAAGTTGATAGAGTCACTGAAAGTGAGAGGGTCCAACTGTCGAATCAGGTCAATGAGGAAGAAAATGATGATGATTATGCTCCTAGAGATGGGGAGGAAACTGAAGATAGCTTAAGTGATAGAGAGTTAGCTGATGAGGATGAGGAATACATTTCAAGCCGTAGGGATATTAGAATTGACAGAGATACCTTTAAAGATATTGGAAGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998088
ATGACTGAAAAGAAGGTTAATGAAAATGATAGTGAGAAGGTTAGTGAGAGGCAAGTTGATAGAGTCACTGAAAGTGAGAGGGTCCAACTGTCGAATCAGGTCAATGAGGAAGAAAATGATGATGATTATGCTCCTAGAGATGGGGAGGAAACTGAAGATAGCTTAAGTGATAGAGAGTTAGCTGATGAGGATGAGGAATACATTTCAAGCCGTAGGGATATTAGAATTGACAGAGATACCTTTAAAGATATTGGAAGATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779504.1
MTEKKVNENDSEKVSERQVDRVTESERVQLSNQVNEEENDDDYAPRDGEETEDSLSDRELADEDEEYISSRRDIRIDRDTFKDIGRCIAEVNDDECMDALTTKAICEGWNLHFSRVGRERCEEPCNRRCYGSVVQARYDLNAFRMRQNFTIDDLRADICERYGIEPKANRLYKAKSIALETLRGLVTAHYAKLRSYLAEMMASDPEGKFELLCNEGAIFRGLYIGFSSLMKGFKAGRRPIIGLDGSFLKTHLGGILLCAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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