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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001541`

染色体: Chr08 坐标: 12585512-12587950 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001541`
名称	SmilChr08G001541
描述	protein PSK SIMULATOR 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12585512 - 12587950 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001086`
GeneID	`131001086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001086`
原始查询	`SmilChr08G001541`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PSK SIMULATOR 3-like
产物	protein PSK SIMULATOR 3-like
Arabidopsis	`AT3G23160` (AT3G23160) plant/protein (DUF668) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821892] identity=57.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0169500` - identity=75.9; qcov=0.187; evalue=1.96e-53; confidence=weak
GO	GO:0045927 (positive regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF05003 (DUF668); PF11961 (DUF3475)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783273.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783273.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783273.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783273.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783273.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12585788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C36,C38,C55
`Chr8:12585813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C36,C38,C55
`Chr8:12585819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B108,B52,B98,C45
`Chr8:12586068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B124
`Chr8:12586111`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B124
`Chr8:12586111`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B124
`Chr8:12586404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B8,D11
`Chr8:12586484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B81
`Chr8:12586628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,C36,C38,C55
`Chr8:12586908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B108,B52,D11
`Chr8:12586910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B46
`Chr8:12586926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B108,B52,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783273.1

578 aa

289

578

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 47-103 aa PF05003 DUF668 406-495 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783273.1`	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	47	103	4.1e-25	88.3	Domain of unknown function (DUF3475)
`XP_057783273.1`	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	406	495	4.6e-33	114.2	Protein of unknown function (DUF668)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927290.1
ATGCAACACTGAAAGTTGCGCAGACCTCAAACTCTGAACTACTGAGGGCCATCTTCTTTCCAATCTGCTCTCACCTTTTTTTAAAAAAAGGCTCTACAAATCTCCTCACACGCACACACACATACAGCATTGGAAAACTCGTGAAATCAAATCCACTGCTTAATACTTTTTCCCTCCATTCTTTTCCTTTTTGCACTCTGTTTTTTTTTACCGATCAATTTACCTTTTTCCAGCTCTGTACTCACCATTTGCACATTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001086
ATGGTGGCTGAGACTTGGATTTTGAGAATGGGGAATCAGGTGAGTAGCAATTTAAAGCATGCTTTGTATTCCGATAATAATTCCACAAAATCATTGAACAAGAAACAAAATCCTTCACATGAGAGACAAATTATTGGTATTCTGTCGTTTGAAGTTGCTAATGTGATGTCCAAGATTATGAATTTGCACAAGTCTTTGTCTGACAATGAGGTGTCTAGGCTCAAAAACGAAATCTTGAAGTCTGATGGGATTAGAACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783273.1
MVAETWILRMGNQVSSNLKHALYSDNNSTKSLNKKQNPSHERQIIGILSFEVANVMSKIMNLHKSLSDNEVSRLKNEILKSDGIRTLVSSDEKQLLELALVEKLDDLSRIAGVVSRLGKKCSIPALQGFEHVYGDVVSGVIDVGELSFLVKDMEGMMRKMERYVTTTVSLYSEMEVMNELESATKKFRENQHEESRKAFEQKLMWQRQDVKHLQDVSLWNQTFDKAMELLARTVCTVYARIHLVFGDGLARAQDCSNGSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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