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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001543`

染色体: Chr08 坐标: 12630918-12636137 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001543`
名称	SmilChr08G001543
描述	enoyl-CoA delta isomerase 2, peroxisomal-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12630918 - 12636137 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001088`
GeneID	`131001088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001088`
原始查询	`SmilChr08G001543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	enoyl-CoA delta isomerase 2, peroxisomal-like
产物	enoyl-CoA delta isomerase 2%2C peroxisomal-like
Arabidopsis	`AT4G14430` (IBR10) indole-3-butyric acid response 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827088] identity=58.9; qcov=1; evalue=1.89e-87; confidence=high
Rice	`Os05g0529200` - identity=45.1; qcov=0.988; evalue=1.81e-61; confidence=high
GO	GO:0004165 (delta(3)-delta(2)-enoyl-CoA isomerase activity); GO:0004300 (enoyl-CoA hydratase activity); GO:0005777 (peroxisome); GO:0006635 (fatty acid beta-oxidation)
KEGG	smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00378 (ECH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057783275.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783275.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057783275.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783275.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783275.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12635271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:12635425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:12635639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B124
`Chr8:12635743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B15,C15
`Chr8:12635769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B27,B82,C20,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783275.1

247 aa

124

247

ECH_1

PF00378 ECH_1 27-213 aa

XP_057783276.1

247 aa

124

247

ECH_1

PF00378 ECH_1 27-213 aa

XP_057783277.1

247 aa

124

247

ECH_1

PF00378 ECH_1 27-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783275.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	27	213	4.6e-21	76.0	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057783276.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	27	213	4.6e-21	76.0	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057783277.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	27	213	4.6e-21	76.0	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927293.1
ATATAGCCTTAATAAAAATAATTAATTTCAATTTCCACCTATGAATAAATCCTCAAGTGACATTTCAACTTGCAATATTTTGACATTTTCTTATTATAAGAGATTATTACATGACATCCACATGTCCAACTCTTTGATTTATTTATTCTAATTGGTCCCATCCACGTATATATTTGTACAAAATAAAACAGGTACGCTAGCTGTTTACCCTTCTCGAAATTCCTTGTTTTGCGCAACTTTTATTTCTATCTCCTCATCCT...

XM_057927294.1
ATATAGCCTTAATAAAAATAATTAATTTCAATTTCCACCTATGAATAAATCCTCAAGTGACATTTCAACTTGCAATATTTTGACATTTTCTTATTATAAGAGATTATTACATGACATCCACATGTCCAACTCTTTGATTTATTTATTCTAATTGGTCCCATCCACGTATATATTTGTACAAAATAAAACAGGTACGCTAGCTGTTTACCCTTCTCGAAATTCCTTGTTTTGCGCAACTTTTATTTCTATCTCCTCATCCT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131001088
ATGTGCACGTTAGAGAAGCGCGGCAGTATCTTCTTCCTCACGCTAACCGGCGCCACCAAGAAAGACCAGGAGCACCGCCTAAACCCGCCACTCATCGCCGCCATCCGCGCGGCGCTAGCTGAAGTCAGATCGCAAGCCGTCCCGGGATCGGCGCTCATCACTCAAGCCGAAGGCCGATTCTTCTCCAACGGCTTCGACCTCCGCCACGCGCAGGCCGTCGGCGCGGCCGCCGGCTCTGCCGATGCTGCGGGGGCAGAGCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057783275.1
MCTLEKRGSIFFLTLTGATKKDQEHRLNPPLIAAIRAALAEVRSQAVPGSALITQAEGRFFSNGFDLRHAQAVGAAAGSADAAGAELLNMVDLFRGVVADLLSLPMPTVAAVTGHAAAAGLILAMSHDYVVMKKSRAVLYLSELDIGMSLPDYFTALIKEKVGSSAARRELALRAAKVDAEAAVRMGIVDAAYDSAEDVAAAAVRTAEELGKKEWSGEAYAEIRKSLYPDVCSLLGLEEKAVMPSKL

XP_057783276.1
MCTLEKRGSIFFLTLTGATKKDQEHRLNPPLIAAIRAALAEVRSQAVPGSALITQAEGRFFSNGFDLRHAQAVGAAAGSADAAGAELLNMVDLFRGVVADLLSLPMPTVAAVTGHAAAAGLILAMSHDYVVMKKSRAVLYLSELDIGMSLPDYFTALIKEKVGSSAARRELALRAAKVDAEAAVRMGIVDAAYDSAEDVAAAAVRTAEELGKKEWSGEAYAEIRKSLYPDVCSLLGLEEKAVMPSKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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