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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G001546

染色体: Chr08 坐标: 12656989-12666584 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G001546
名称SmilChr08G001546
描述TNF receptor-associated factor homolog 1b-like
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向12656989 - 12666584 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131001090
GeneID131001090
locus_tag-
NCBI NameLOC131001090
原始查询SmilChr08G001546

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述TNF receptor-associated factor homolog 1b-like
产物TNF receptor-associated factor homolog 1b-like
ArabidopsisAT1G04300 (AT1G04300)
TRAF-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839551]
identity=47.7; qcov=0.999; evalue=0.0; confidence=high
RiceOs01g0775300 (OsM1)
-
identity=65.55; qcov=0.416; evalue=0.0; confidence=low
GOGO:0005515 (protein binding)
KEGG-
PfamPF00917 (MATH); PF22486 (MATH_2)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131001090

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五折投票；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，投票比例不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

Rank定位位置中文五折投票比例Protein ID
1 Cytosol 细胞质基质 0.60000 XP_057783278.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.40000 XP_057783281.1
3 Nucleus 细胞核 0.40000 XP_057783278.1
4 Cell membrane 细胞膜 0.40000 XP_057783278.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:12658040 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A11,B138,C47
Chr8:12658042 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A5,B66,B76
Chr8:12658152 A AC 1bp_insertion frameshift_variant 58 A11,A25,A3,A4,A9,B101,B105,B108,B117,B129,B131,B138,B2,B35,B38,B4,B49,B52,B57,B6,B60,B70,B73,B74,B76,B77,B79,B82,B89,B9,B99,C10,C13,C16,C18,C2,C20,C23,C27,C32,C41,C47,C48,C5,C55,C62,C67,C72,C76,C77,C79,C8,C80,C84,C86,D7,D8,D9
Chr8:12658182 T TTA 2bp_insertion frameshift_variant 2 C87,D6
Chr8:12658182 T TTA 2bp_insertion CDS_variant 2 C87,D6
Chr8:12658196 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 88 A10,A25,A5,A6,A7,A9,B10,B101,B102,B105,B106,B111,B112,B115,B12,B122,B125,B128,B129,B130,B132,B135,B137,B14,B17,B2,B23,B4,B42,B43,B45,B46,B48,B54,B55,B60,B61,B66,B74,B76,B77,B79,B80,B83,B86,B89,B9,B93,B98,B99,C1,C10,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C27,C28,C33,C37,C40,C47,C48,C5,C53,C55,C56,C59,C60,C62,C69,C7,C72,C79,C80,C81,C84,C86,C9,D4,D6,D8
Chr8:12660047 A AC 1bp_insertion frameshift_variant 1 C31
Chr8:12660047 A AC 1bp_insertion CDS_variant 1 C31
Chr8:12662176 TC T 1bp_deletion frameshift_variant 1 B86
Chr8:12662176 TC T 1bp_deletion CDS_variant 1 B86
Chr8:12662187 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B86
Chr8:12663181 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783278.1
1198 aa
N
1
599
1198
MATH_2
MATH
C
PF22486 MATH_2 73-193 aa PF00917 MATH 78-195 aa
XP_057783279.1
1198 aa
N
1
599
1198
MATH_2
MATH
C
PF22486 MATH_2 73-193 aa PF00917 MATH 78-195 aa
XP_057783281.1
1195 aa
N
1
598
1195
MATH_2
MATH
C
PF22486 MATH_2 73-193 aa PF00917 MATH 78-195 aa
XP_057783282.1
1186 aa
N
1
593
1186
MATH_2
MATH
C
PF22486 MATH_2 73-193 aa PF00917 MATH 78-195 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057783278.1 Pfam PF22486 MATH_2 Domain 73 193 3.6e-33 115.4 MATH domain
XP_057783278.1 Pfam PF00917 MATH Domain 78 195 8.5e-22 78.3 MATH domain
XP_057783279.1 Pfam PF22486 MATH_2 Domain 73 193 3.6e-33 115.4 MATH domain
XP_057783279.1 Pfam PF00917 MATH Domain 78 195 8.5e-22 78.3 MATH domain
XP_057783281.1 Pfam PF22486 MATH_2 Domain 73 193 3.5e-33 115.4 MATH domain
XP_057783281.1 Pfam PF00917 MATH Domain 78 195 8.5e-22 78.3 MATH domain
XP_057783282.1 Pfam PF22486 MATH_2 Domain 73 193 3.5e-33 115.4 MATH domain
XP_057783282.1 Pfam PF00917 MATH Domain 78 195 8.4e-22 78.3 MATH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA
XM_057927296.1
AGAGAGATATAACAAGAGAGTGTGAGGAAACACATATCTGCATATAAATTGTTGAAGTTAATATTTTTATTTTTTATTGCGTGTGGATCAATTGGCTATATTAATAGTAATATCAGTAAAATGAAAAGTGAAACCCTATTCCAAAACTATATTACAACACACACAACACACACACACATGAAATTATATATAAATAAGTAATAAAAATTGCGAGAATTTTATTTCCTCCGCTTCTGCTCTTTCTGCTGCTGCTTTTTTCT...
XM_057927299.1
CTATTCCAAAACTATATTACAACACACACAACACACACACACATGAAATTATATATAAATAAGTAATAAAAATTGCGAGAATTTTATTTCCTCCGCTTCTGCTCTTTCTGCTGCTGCTTTTTTCTTTTCCCTGCGACCTCTCTAATCTCTCTTGACTACTCATTCGCCTAATTATTGAACAAAGCTTCGTTCTTTCTTAATTAAGGTGACGTAGAGGAAGTGTGCCGGGTATTACGGAGTGGGGAAAATGGCTGGAGTTG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783278.1_42240
ATGGCTGGAGTTGCAACTGAGGAGGCTGGAGCTGGACGATCATTTGAAGGTGTTTCAACTGGGCAACAGCAGCTGCGATGTCAGTCTGGGGAAGCATTAGCTGAATGGCGGTCTTCAGAGCAGGTTGAAAATGGGAGTCCATCCACTTCTCCCCCTTACTGGGACAGTGACGACGACGACGATGATGGAGGACCCAAGCCATCTGACTTATATGGAAAGTATACATGGAAGATTGATAAGTTTTCTCAAATTAACAAAAG...
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057783279.1_42241
ATGGCTGGAGTTGCAACTGAGGAGGCTGGAGCTGGACGATCATTTGAAGGTGTTTCAACTGGGCAACAGCAGCTGCGATGTCAGTCTGGGGAAGCATTAGCTGAATGGCGGTCTTCAGAGCAGGTTGAAAATGGGAGTCCATCCACTTCTCCCCCTTACTGGGACAGTGACGACGACGACGATGATGGAGGACCCAAGCCATCTGACTTATATGGAAAGTATACATGGAAGATTGATAAGTTTTCTCAAATTAACAAAAG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA
XP_057783278.1
MAGVATEEAGAGRSFEGVSTGQQQLRCQSGEALAEWRSSEQVENGSPSTSPPYWDSDDDDDDGGPKPSDLYGKYTWKIDKFSQINKRELRSNAFEVGGYKWYILIYPQGCDVCNHLSLFLCVANHDKLLPGWSHFAQFTIAVVNKDPKKSKYSDTLHRFWKKEHDWGWKKFMELSKVLDGFIDADTLIIKAQVQVIRERADRPFRCLDCQYRRELVRVYLTNVEQICRRFVEERRAKLGKLLEDKARWSSFCAFWLGMDQ...
XP_057783279.1
MAGVATEEAGAGRSFEGVSTGQQQLRCQSGEALAEWRSSEQVENGSPSTSPPYWDSDDDDDDGGPKPSDLYGKYTWKIDKFSQINKRELRSNAFEVGGYKWYILIYPQGCDVCNHLSLFLCVANHDKLLPGWSHFAQFTIAVVNKDPKKSKYSDTLHRFWKKEHDWGWKKFMELSKVLDGFIDADTLIIKAQVQVIRERADRPFRCLDCQYRRELVRVYLTNVEQICRRFVEERRAKLGKLLEDKARWSSFCAFWLGMDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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