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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001548`

染色体: Chr08 坐标: 12685212-12685733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001548`
名称	SmilChr08G001548
描述	polygalacturonase inhibitor-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12685212 - 12685733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998090`
GeneID	`130998090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998090`
原始查询	`SmilChr08G001548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase inhibitor-like
产物	polygalacturonase inhibitor-like
Arabidopsis	`AT5G06860` (PGIP1) polygalacturonase inhibiting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830577] identity=52.7; qcov=0.696; evalue=2.35e-36; confidence=medium
Rice	`Os05g0104200` (PGIP1) - identity=54.3; qcov=0.72; evalue=1.56e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057779506.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057779506.1`
3	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057779506.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779506.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12685286`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B136,B23,B26,B81,C18,C46,C77
`Chr8:12685340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C55
`Chr8:12685412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C23
`Chr8:12685414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D8
`Chr8:12685414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:12685542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B120,B35,C41,C61
`Chr8:12685625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:12685666`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B23,D4
`Chr8:12685666`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B23,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779506.1

161 aa

161

LRRNT_2

PF08263 LRRNT_2 34-71 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779506.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	34	71	5.3e-13	49.7	Leucine rich repeat N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923523.1
TTTGGCAGAAATGATAGTAGACCGAAAGCAAGCACGATGAAGCTCTCTCTTCTCCCCATTAATATTGTCTCTCTCCTCATCACCATTATCCTATCCCAATCCCCAGTCTCTCTCTCCGAAACCGAAAGGTGCAACCCTCAAGACAAACAAGCCCTCCTAAACATCAAGAAAGCCTTCAACAATGCCTACCACTTCGCCTCGTGGCGCCCCGACACCGACTGCTGCGACTGGTACATCGTCATGTGCGACCGCCACACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998090
ATGAAGCTCTCTCTTCTCCCCATTAATATTGTCTCTCTCCTCATCACCATTATCCTATCCCAATCCCCAGTCTCTCTCTCCGAAACCGAAAGGTGCAACCCTCAAGACAAACAAGCCCTCCTAAACATCAAGAAAGCCTTCAACAATGCCTACCACTTCGCCTCGTGGCGCCCCGACACCGACTGCTGCGACTGGTACATCGTCATGTGCGACCGCCACACCAATAGAATCATCTCCCTCGACATTTTCGCCGCCAACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779506.1
MKLSLLPINIVSLLITIILSQSPVSLSETERCNPQDKQALLNIKKAFNNAYHFASWRPDTDCCDWYIVMCDRHTNRIISLDIFAANLSGTIPDAVADLPSLKTLTFHKITNLSGTIPVALTKLTNLEMLTISWTDISGAIPVGKYTQILPPIIKSKAISKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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