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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001549`

染色体: Chr08 坐标: 12690867-12691775 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001549`
名称	SmilChr08G001549
描述	polygalacturonase inhibitor-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12690867 - 12691775 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998092`
GeneID	`130998092`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998092`
原始查询	`SmilChr08G001549`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase inhibitor-like
产物	polygalacturonase inhibitor-like
Arabidopsis	`AT5G06860` (PGIP1) polygalacturonase inhibiting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830577] identity=42.1; qcov=1.07; evalue=2.15e-35; confidence=medium
Rice	`Os05g0104200` (PGIP1) - identity=39; qcov=0.962; evalue=1.64e-29; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998092

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057779507.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057779507.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779507.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779507.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12691103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr8:12691121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:12691150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,C41,C61
`Chr8:12691212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B35,C41,C61
`Chr8:12691338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B47,C17,C62
`Chr8:12691340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779507.1

184 aa

184

LRR_8

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF13855 LRR_8 39-78 aa PF00560 LRR_1 43-65 aa PF00560 LRR_1 68-88 aa PF13516 LRR_6 93-104 aa PF00560 LRR_1 93-107 aa PF00560 LRR_1 117-137 aa PF00560 LRR_1 140-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779507.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	39	78	9.3e-15	54.9	Leucine rich repeat
`XP_057779507.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	43	65	3.9e-19	65.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057779507.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	68	88	3.9e-19	65.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057779507.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	93	104	5.3e-05	23.7	Leucine Rich repeat
`XP_057779507.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	93	107	3.9e-19	65.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057779507.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	117	137	3.9e-19	65.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057779507.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	140	157	3.9e-19	65.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923524.1
ATGGGGCTGCACTTTCCTCTTTGGTGGTGGCAAAGTTGTGGTGGTGGCAAACAACTTTCTCAAAGTTGTGGTGGTGGAGCCTCCATGTTTTGGCTAACAATCCCCTCCGACCTAAGCCGCCTCAAAAGCCTCAAATACATGCTCCTATCACACAACAAGTTGAGCAGGTCGATCCCTCCTTCTCTGGCCCAGCTCAGCAAACTGGATGAGCTGAAGCTGGACCGTAACAAGCTCACGGGGAGCATCCCAGACTCGTTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998092
ATGGGGCTGCACTTTCCTCTTTGGTGGTGGCAAAGTTGTGGTGGTGGCAAACAACTTTCTCAAAGTTGTGGTGGTGGAGCCTCCATGTTTTGGCTAACAATCCCCTCCGACCTAAGCCGCCTCAAAAGCCTCAAATACATGCTCCTATCACACAACAAGTTGAGCAGGTCGATCCCTCCTTCTCTGGCCCAGCTCAGCAAACTGGATGAGCTGAAGCTGGACCGTAACAAGCTCACGGGGAGCATCCCAGACTCGTTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779507.1
MGLHFPLWWWQSCGGGKQLSQSCGGGASMFWLTIPSDLSRLKSLKYMLLSHNKLSRSIPPSLAQLSKLDELKLDRNKLTGSIPDSFWNAPVSFKSLDLSHNQLSGGINLKTQFPHGLENLYLSHNKISGALPEGLAKAKSLMYLDVSYNRLCGRIPTGGVLQKMDYSAYFHNKCLCGPPLPNCK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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