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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001551`

染色体: Chr08 坐标: 12706687-12710135 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001551`
名称	SmilChr08G001551
描述	protein WVD2-like 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12706687 - 12710135 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001093`
GeneID	`131001093`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001093`
原始查询	`SmilChr08G001551`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein WVD2-like 3
产物	protein WVD2-like 3
Arabidopsis	`AT3G23090` (AT3G23090) TPX2 (targeting protein for Xklp2) protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821884] identity=47; qcov=0.826; evalue=1.8e-70; confidence=high
Rice	`Os03g0799100` (BIP116) - identity=48.8; qcov=0.541; evalue=9.8e-48; confidence=medium
GO	GO:0000226 (microtubule cytoskeleton organization); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	PF06886 (TPX2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001093

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057783285.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057783285.1`
3	Spindle	Spindle	0.20000	`XP_057783285.1`
4	Spindle pole	Spindle pole	0.20000	`XP_057783285.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783285.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12707561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr8:12708105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C25,C45
`Chr8:12708181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:12708192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:12708416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:12708847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B52
`Chr8:12708876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B52
`Chr8:12709838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C59
`Chr8:12709852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C21,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783285.1

398 aa

199

398

TPX2

PF06886 TPX2 241-317 aa

XP_057783286.1

386 aa

193

386

TPX2

PF06886 TPX2 229-305 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783285.1`	Pfam	`PF06886`	TPX2	Domain	241	317	2.2e-25	89.1	Targeting protein for Xklp2 (TPX2) domain
`XP_057783286.1`	Pfam	`PF06886`	TPX2	Domain	229	305	2.1e-25	89.2	Targeting protein for Xklp2 (TPX2) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927303.1
CAACTAACGTCGTTATTTTATTCCACCCCTTCTCTCTATAACTATCTGCAACAGAAGACAGAAAAAGCCCACCGTCACACACACTACACACACTGGGAGTTCACGGAAGCTCTTGATAAGAAAAACTCAGAAGCCAAATTAGGCAAAAAGATTTTACTTTTAGCATATCCTGATATGGAAATAGATGGCAACGATGTTCATATTGACAAGGAGCCAGATGGTGTCATAATATACGCAAATGGTGTCACCCACGGTTCAGG...

XM_057927302.1
GAAAATATTGAATCATCGTTTGTTTGGACACTCATTTGTGTTTCCTATTGATAAACCTGTTAGAATTCTGAAGTCTGAGTCAATATGATTAGGTTTGTACATTTGGGAAAATGGATGCCACCATAAGTGAATCAGATCATAGTGATATGGAAATAGATGGCAACGATGTTCATATTGACAAGGAGCCAGATGGTGTCATAATATACGCAAATGGTGTCACCCACGGTTCAGGTTGTGGAAATGCTTGCCTGCAGGATGTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001093
ATGGATGCCACCATAAGTGAATCAGATCATAGTGATATGGAAATAGATGGCAACGATGTTCATATTGACAAGGAGCCAGATGGTGTCATAATATACGCAAATGGTGTCACCCACGGTTCAGGTTGTGGAAATGCTTGCCTGCAGGATGTGGCACAGCTGTCTGAGATTATCGACATTGATCCACAGCTTGTTGATATATCCGATGAGAATGCCGAGGTACAGGATTGTGTGGTAAAAGAATGCAATAGTGTCAAGTCCGA...

LOC131001093
ATGGAAATAGATGGCAACGATGTTCATATTGACAAGGAGCCAGATGGTGTCATAATATACGCAAATGGTGTCACCCACGGTTCAGGTTGTGGAAATGCTTGCCTGCAGGATGTGGCACAGCTGTCTGAGATTATCGACATTGATCCACAGCTTGTTGATATATCCGATGAGAATGCCGAGGTACAGGATTGTGTGGTAAAAGAATGCAATAGTGTCAAGTCCGAGGAAACAAAACCTTGTCAGCAGGAGACATCTGAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783285.1
MDATISESDHSDMEIDGNDVHIDKEPDGVIIYANGVTHGSGCGNACLQDVAQLSEIIDIDPQLVDISDENAEVQDCVVKECNSVKSEETKPCQQETSEESVPESKSASEKDDVKSEGQKMRDHDKKTQACGRKATKPAVGSCKTKCTVPQPFALATEKRALHGARPNGPECDNTTGGDKPSHIRVPLQPSSVKQNLIVAPIVQRKPLQPDNKKLVDEDNCSVASSVAPARKYKITVASAPTFKSSERAERRREFFSKLEE...

XP_057783286.1
MEIDGNDVHIDKEPDGVIIYANGVTHGSGCGNACLQDVAQLSEIIDIDPQLVDISDENAEVQDCVVKECNSVKSEETKPCQQETSEESVPESKSASEKDDVKSEGQKMRDHDKKTQACGRKATKPAVGSCKTKCTVPQPFALATEKRALHGARPNGPECDNTTGGDKPSHIRVPLQPSSVKQNLIVAPIVQRKPLQPDNKKLVDEDNCSVASSVAPARKYKITVASAPTFKSSERAERRREFFSKLEEKHQALEAEKNQY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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