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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001555`

染色体: Chr08 坐标: 12762276-12766798 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001555`
名称	SmilChr08G001555
描述	phosphatidate cytidylyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12762276 - 12766798 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001098`
GeneID	`131001098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001098`
原始查询	`SmilChr08G001555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidate cytidylyltransferase 1-like
产物	phosphatidate cytidylyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT4G22340` (CDS2) cytidinediphosphate diacylglycerol synthase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828329] identity=77.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0758400` - identity=74.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004605 (phosphatidate cytidylyltransferase activity); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01148 (CTP_transf_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057783295.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057783295.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783295.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783295.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12763697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B15,B56,B96,C15
`Chr8:12763873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:12763894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:12766272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr8:12766285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,D10,D11,D8
`Chr8:12766463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783295.1

424 aa

N

1

212

424

CTP_transf_1

C

PF01148 CTP_transf_1 51-381 aa

XP_057783296.1

424 aa

N

1

212

424

CTP_transf_1

C

PF01148 CTP_transf_1 51-381 aa

XP_057783297.1

424 aa

N

1

212

424

CTP_transf_1

C

PF01148 CTP_transf_1 51-381 aa

XP_057783299.1

424 aa

N

1

212

424

CTP_transf_1

C

PF01148 CTP_transf_1 51-381 aa

XP_057783300.1

424 aa

N

1

212

424

CTP_transf_1

C

PF01148 CTP_transf_1 51-381 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783295.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	51	381	9.3e-78	262.4	Cytidylyltransferase family
`XP_057783296.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	51	381	9.3e-78	262.4	Cytidylyltransferase family
`XP_057783297.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	51	381	9.3e-78	262.4	Cytidylyltransferase family
`XP_057783299.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	51	381	9.3e-78	262.4	Cytidylyltransferase family
`XP_057783300.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	51	381	9.3e-78	262.4	Cytidylyltransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927313.1
CAATAATCTTTAACATAATCACTAATTTCCCCCAAAAATTGAATAGACGGTATCATTCGAGCACTTTTAAGTTCATGGTTTGCACTCTTTTTGTTACAAACAACCTCTCAAACACACACACACACACACACAAAGTGTTAACATTTCTGGTGGGATTTTAAGCCTGGAGAAATATGCGAAAGGATCCTGGTTCTGGGTGCCCATCAACACCTACTGCGCGCTTACGTCGGCGCAAAGGTTCCAATGAGGCCCCTCCTGAA...

XM_057927317.1
ATCTTTAACATAATCACTAATTTCCCCCAAAAATTGAATAGACGGTATCATTCGAGCACTTTTAAGTTCATGGTTTGCACTCTTTTTGTTACAAACAACCTCTCAAACACACACACACACACACACAAAGTGGTAAGATCCCGCTCTGCCTCTTAATCTCCCGTTTCTTCCTCCTTTCATCTATTCTCTTGTAAATCTTGTATAATTTTGTTGTTTTCAATCGTAAGGCGGCACGCATACTATTTGTGGGAGTTAACATT...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131001098
ATGCGAAAGGATCCTGGTTCTGGGTGCCCATCAACACCTACTGCGCGCTTACGTCGGCGCAAAGGTTCCAATGAGGCCCCTCCTGAAGTTGATAAATCTAATGGCAACAATTTGCTTGTTAATGATCGTAACAAGTACAAGTCGTTTTTGATCCGTGCATACTCAACTGTTTGGATGATTGGAGGGTTCAGCTTCGTAATATACATGGGACACCTATATATCTGGGCAATGGTAGTAGTTATCCAGATTTTCATGGCCAA...

LOC131001098
ATGCGAAAGGATCCTGGTTCTGGGTGCCCATCAACACCTACTGCGCGCTTACGTCGGCGCAAAGGTTCCAATGAGGCCCCTCCTGAAGTTGATAAATCTAATGGCAACAATTTGCTTGTTAATGATCGTAACAAGTACAAGTCGTTTTTGATCCGTGCATACTCAACTGTTTGGATGATTGGAGGGTTCAGCTTCGTAATATACATGGGACACCTATATATCTGGGCAATGGTAGTAGTTATCCAGATTTTCATGGCCAA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057783295.1
MRKDPGSGCPSTPTARLRRRKGSNEAPPEVDKSNGNNLLVNDRNKYKSFLIRAYSTVWMIGGFSFVIYMGHLYIWAMVVVIQIFMAKELFNLLRRASEDRRLPGFRLLNWHFFFTAMLFVYGRILNLRLVNTVASDKVLYKLVSRFIKYHMVTCYFLYIAGFMWFILTLKKKMYKYQFGQFAWTHMILIVVFTQSSFTVANIFEGIFWFLLPASLIIVNDIAAYIFGFFFGKTPLIKLSPKKTWEGFIGASVATVISAFL...

XP_057783296.1
MRKDPGSGCPSTPTARLRRRKGSNEAPPEVDKSNGNNLLVNDRNKYKSFLIRAYSTVWMIGGFSFVIYMGHLYIWAMVVVIQIFMAKELFNLLRRASEDRRLPGFRLLNWHFFFTAMLFVYGRILNLRLVNTVASDKVLYKLVSRFIKYHMVTCYFLYIAGFMWFILTLKKKMYKYQFGQFAWTHMILIVVFTQSSFTVANIFEGIFWFLLPASLIIVNDIAAYIFGFFFGKTPLIKLSPKKTWEGFIGASVATVISAFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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