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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001557`

染色体: Chr08 坐标: 12792744-12794520 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001557`
名称	SmilChr08G001557
描述	auxin-responsive protein IAA7-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12792744 - 12794520 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001100`
GeneID	`131001100`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001100`
原始查询	`SmilChr08G001557`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-responsive protein IAA7-like
产物	auxin-responsive protein IAA7-like
Arabidopsis	`AT4G14550` (IAA14) indole-3-acetic acid inducible 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827102] identity=72; qcov=1.02; evalue=4.7e-116; confidence=high
Rice	`Os12g0601300` (OsIAA30) - identity=54.5; qcov=1.23; evalue=4.31e-82; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02309 (AUX_IAA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001100

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783302.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783302.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783302.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783302.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783302.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12793465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:12793466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:12793557`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B1,C8
`Chr8:12793557`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B1,C8
`Chr8:12793567`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A20,B1,B121,B133,B139,B38,B41,B48,B68,B70,B72,B77,B79,B84,B99,C11,C12,C16,C21,C30,C36,C52,C8,D2,D7
`Chr8:12793570`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A20,B1,B121,B133,B139,B38,B41,B48,B68,B70,B72,B77,B79,B84,B99,C11,C12,C16,C21,C30,C36,C52,C8,D2,D7
`Chr8:12793575`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A14,B101,B117,B18,B28,B40,B47,B50,B7,B8,C18,D3
`Chr8:12793587`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	210	A1,A13,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B26,B27,B29,B3,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B61,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B86,B88,B9,B91,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D7,D8
`Chr8:12793787`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A23,B44,B45,B51,B64,B73,C10,C12,C18,C21,C24,C3,C37
`Chr8:12793790`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A23,B44,B45,B51,B64,B73,C10,C12,C21,C24,C3,C37
`Chr8:12793801`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B44,B45,B51,B64,C10,C21
`Chr8:12793826`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B44,B51,C10,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783302.1

227 aa

114

227

AUX_IAA

PF02309 AUX_IAA 9-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783302.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	9	218	3.2e-84	282.9	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927319.1
TTTTGGGAAATTCTTTATGAGTTATTTTTTGGTTAATTAAAGCAAGTAACAATCATTATCTCAACAAAATGCTCTTGATCCAAGATGATGAAAACACCACGTGTCAGCACGCGATTCCTCGCAACATGATGAGCCATTCGCATACAGCTATATATATTCACACCAAACTCACACACATTTGCTCTTGCTCCCTTGTCAAAAATTTTATTACTACAAACACGCACATTTCTCTACAGCCACTCCAAGAGAAAAAAGGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001100
ATGGAAGTCGGCCTGAATCTGAAGGCGACCGAGCTCTGCCTCGGCTTGCCCGGCGGCGAAGTGAATATCAACGGGAAAAGAGGTTTTTCTGAGACGATCGATCTCAAACTCAACCTAAAGTCAAACGAGTCTGCTGGTTTGGATCTGAAGGAAAACATGCAGAATTCTTCCAAAGAGAAAGCTATGCTACCTCCCAAGGATCACATCAAGCCTCCTTCAAAGGCACAAGTGGTGGGATGGCCACCGGTGAGGGCGTTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783302.1
MEVGLNLKATELCLGLPGGEVNINGKRGFSETIDLKLNLKSNESAGLDLKENMQNSSKEKAMLPPKDHIKPPSKAQVVGWPPVRAFRKNIMSQQKSEEESEKAACSGGAAFVKVSMDGAPYLRKVDLKMYKSYQELSDALAKMFSSFTMGNYGTEGMIDFMNERKLMDLLNTSEYVPSYEDKDGDWMLVGDVPWEMFVESCKRLRIMKGSEAIGLAPRAMEKCKSRC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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