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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001559`

染色体: Chr08 坐标: 12849015-12852532 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001559`
名称	SmilChr08G001559
描述	rRNA-processing protein EFG1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	12849015 - 12852532 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001102`
GeneID	`131001102`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001102`
原始查询	`SmilChr08G001559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rRNA-processing protein EFG1-like
产物	rRNA-processing protein EFG1-like
Arabidopsis	`AT1G04230` (AT1G04230) rRNA-processing EFG1-like protein (DUF2361) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839575] identity=55; qcov=0.992; evalue=4.39e-99; confidence=high
Rice	`Os03g0797700` (OSJNBa0094F01.10) - identity=61.5; qcov=0.752; evalue=1.72e-79; confidence=high
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0030688 (preribosome, small subunit precursor)
KEGG	-
Pfam	PF10153 (Efg1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001102

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783303.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057783303.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783303.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783303.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783303.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:12849274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr8:12849331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B67,B7,C33
`Chr8:12849451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D3
`Chr8:12849612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:12849757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr8:12850902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C21,C36
`Chr8:12851394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:12852274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:12852333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783303.1

363 aa

182

363

Efg1

PF10153 Efg1 45-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783303.1`	Pfam	`PF10153`	Efg1	Family	45	155	3.5e-31	108.6	rRNA-processing protein Efg1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927320.1
GGCCGGGTCGAGCCGTCGGGTTGAGTCGATTTTGCAGCTCTAGTATGCTTGTGCAAAACTAATTTTCACTGACAAAGTTGAAAGCTTGGAAAGTCACCGGAGATAAGTCGCCAAAACGACGTCGTATGGTCTGTGCATAAATACCAAAGATTGTGTGAGGAAAGGTATTAGTTATCGCAGATGGGGCACGGCGGCTACGGGAAGCGCAGTGGCGCCGCCATCGAGAGGAAGAAGCCCGCCGGCCAGCGCCGCCCCAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001102
ATGGGGCACGGCGGCTACGGGAAGCGCAGTGGCGCCGCCATCGAGAGGAAGAAGCCCGCCGGCCAGCGCCGCCCCAAGGCCTTAGCAATTGACAAGAAGTCCAAGGCCACCAAGCCCAAATCCGTCACTTTCAAGAACCAAATCCGCTCCATTGAACGCATGCTTCGCAAAGATCTGCCTCTTGAAATAAAGGAAGCTCAAGAGAAGAAGTTGGAGGAACTCAAGAGACAACAGGATATTCAAAATCGTCTGGCTCTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783303.1
MGHGGYGKRSGAAIERKKPAGQRRPKALAIDKKSKATKPKSVTFKNQIRSIERMLRKDLPLEIKEAQEKKLEELKRQQDIQNRLALERKIFLRYRRIKFFERRKIERRIRRLEKQQRASTGQAQEADISEQLSKLKEDLEYVKFFPKTEKYVSLYVGGDEAEIVEKRNTLRKQIKDNLIAAAASGKDLEETGSEDDGTLDPSDDDFFLNGSSSEEAEADDEWSARDQASSASGKAASGMSSDERNQKLISARALMPPPGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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