当前解析结果
SmilChr08G001571| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001571 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001571 |
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein subunit gamma 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 12920866 - 12922198 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131001113 |
|---|---|
| GeneID | 131001113 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001113 |
| 原始查询 | SmilChr08G001571 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein subunit gamma 2-like |
| 产物 | guanine nucleotide-binding protein subunit gamma 2-like |
| Arabidopsis | AT3G22942 (AGG2)G-protein gamma subunit 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825532] identity=61; qcov=1.03; evalue=2.87e-30; confidence=medium |
| Rice | Os03g0635100 (RGG1)- identity=57.3; qcov=0.845; evalue=1.56e-24; confidence=medium |
| GO | GO:0007186 (G protein-coupled receptor signaling pathway) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00631 (G-gamma) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001113 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057783324.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057783324.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057783324.1 |
| 4 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057783324.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783324.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:12921777 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr8:12921849 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,B84,C20 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783324.1PF00631
G-gamma 24-96 aa
XP_057783325.1PF00631
G-gamma 24-96 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783324.1 |
Pfam | PF00631 |
G-gamma | Domain | 24 | 96 | 2.2e-12 | 47.5 | GGL domain |
XP_057783325.1 |
Pfam | PF00631 |
G-gamma | Domain | 24 | 96 | 2.2e-12 | 47.5 | GGL domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。