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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001594`

染色体: Chr08 坐标: 13178597-13181066 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001594`
名称	SmilChr08G001594
描述	40S ribosomal protein S3a-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13178597 - 13181066 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001147`
GeneID	`131001147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001147`
原始查询	`SmilChr08G001594`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S3a-like
产物	40S ribosomal protein S3a-like
Arabidopsis	`AT4G34670` (AT4G34670) Ribosomal protein S3Ae [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829619] identity=80.5; qcov=1.01; evalue=5.02e-153; confidence=high
Rice	`Os12g0406200` - identity=80.7; qcov=0.996; evalue=3.04e-149; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005829 (cytosol); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01015 (Ribosomal_S3Ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783399.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783399.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783399.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783399.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13178904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B69,C84
`Chr8:13178915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr8:13179094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:13179824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr8:13180012`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A18,A22,A5,A9,B1,B11,B111,B127,B130,B131,B134,B20,B22,B25,B28,B5,B77,B79,B82,B86,B9,B98,C27,C29,C31,C34,C35,C41,C43,C49,C5,C52,C56,C59,C73,C84
`Chr8:13180453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:13180807`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	B100,B107,B117,B121,B123,B133,B27,B38,B39,B48,B50,B66,B69,B89,B95,C74,C78,C79,D3,D5
`Chr8:13180819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783399.1

260 aa

130

260

Ribosomal_S3Ae

PF01015 Ribosomal_S3Ae 16-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783399.1`	Pfam	`PF01015`	Ribosomal_S3Ae	Family	16	221	1e-81	273.9	Ribosomal S3Ae family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927416.1
GCGAGTTGGATGTGCATAATTTTTAACTAGACTGCATATTAGCACACTACCAAAAGCCCAAAAGCCTCATTAAAACTCAAAGCCTTGTTGTTGCTGCTAGGGTTTATTTTGCTTAGCGCACATCTCAAACAGGAAGAGCTTTCTCTCATCTCACAAGCGCAGCTTCTCTTCCACCATGGCAGTAGGAAAGAATAAGAGAATCTCAAAGGGAAAGAAGGGAGGGAAGAAGAAGGCTGTTGATCCATTTGCAAAGAAGGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001147
ATGGCAGTAGGAAAGAATAAGAGAATCTCAAAGGGAAAGAAGGGAGGGAAGAAGAAGGCTGTTGATCCATTTGCAAAGAAGGAGTGGTATGATATCAAAGCCCCTTCAGTCTTCAGCAACAAGAACGTCGGGAAAACCCTAATTACTCGTACTCAGGGTACCAAGATTGCCTCAGAAGGGCTCAAGCACCGTGTGGTCGAGGCGTCCTTGGCTGATCTTCAAGGTGATGAGGATCACGCATACAGAAAGATTCGCTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783399.1
MAVGKNKRISKGKKGGKKKAVDPFAKKEWYDIKAPSVFSNKNVGKTLITRTQGTKIASEGLKHRVVEASLADLQGDEDHAYRKIRLRVEDVQGKNVLTNFWGMDFTTDKLRSLVRKRQSLIEAHIDVKTTDAYTLRMFCIAFTKKRVNQQKVTCYAKTSQVRQIRRKMREIMVNQAQSCSLKELVQKFIPESIGKEIEKATSSIYPLQNVYIRKVKILKAPKFDLGKLMEVHGDYTEDLGAKLDRPVEEPVAEPTEVVGA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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