当前解析结果
SmilChr08G001623| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001623 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001623 |
| 描述 | electron transfer flavoprotein subunit beta, mitochondrial |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 13434320 - 13437455 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001168 |
|---|---|
| GeneID | 131001168 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001168 |
| 原始查询 | SmilChr08G001623 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | electron transfer flavoprotein subunit beta, mitochondrial |
| 产物 | electron transfer flavoprotein subunit beta%2C mitochondrial |
| Arabidopsis | AT5G43430 (ETFBETA)electron transfer flavoprotein beta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834363] identity=78.1; qcov=1; evalue=1.7e-147; confidence=high |
| Rice | Os04g0182800 (ETFB)- identity=77.2; qcov=1.02; evalue=2.91e-143; confidence=high |
| GO | GO:0005829 (cytosol); GO:0009055 (electron transfer activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01012 (ETF) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001168 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057783465.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057783465.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057783465.1 |
| 4 | Mitochondrion matrix | 线粒体基质 | 0.40000 | XP_057783465.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783465.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:13434498 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,D3 |
Chr8:13434711 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B121,B70,C16 |
Chr8:13434817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,C11,C69 |
Chr8:13434871 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B23,B87,C18,C46 |
Chr8:13436929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:13436953 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:13436954 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr8:13437214 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:13437220 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
Chr8:13437311 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr8:13437315 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B99,C20 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783465.1PF01012
ETF 26-208 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783465.1 |
Pfam | PF01012 |
ETF | Domain | 26 | 208 | 2.5e-38 | 132.4 | Electron transfer flavoprotein domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。