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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001624`

染色体: Chr08 坐标: 13441191-13444230 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001624`
名称	SmilChr08G001624
描述	transcription factor ILR3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13441191 - 13444230 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001169`
GeneID	`131001169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001169`
原始查询	`SmilChr08G001624`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor ILR3-like
产物	transcription factor ILR3-like
Arabidopsis	`AT4G14410` (bHLH104) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827086] identity=53.1; qcov=0.758; evalue=3.16e-68; confidence=high
Rice	`Os08g0138500` (OsPRI1) - identity=42.2; qcov=0.809; evalue=5.2e-49; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006879 (intracellular iron ion homeostasis); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783466.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783466.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783466.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783466.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13441358`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B4,B40,B71,C38,C80
`Chr8:13441358`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B4,B40,B71,C38,C80
`Chr8:13441388`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr8:13441388`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr8:13441419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B24
`Chr8:13441642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:13443577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:13443607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:13443902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:13443903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783466.1

293 aa

146

293

bHLH_IRO3

HLH

PF23177 bHLH_IRO3 141-228 aa PF00010 HLH 142-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783466.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	141	228	1.4e-39	135.0	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain
`XP_057783466.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	142	190	1.3e-10	41.6	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927483.1
TTGGCATCGGCATCGCATCAGATGAAAAATCGCACTTGAACATCATTTCACTGCTTTATGTATTTTCACGCATATATGCGGCGACTCAAATAACAACTTTGTTGATTTAGCAAAGCCAATAATTGACGCAGCCATCCACGTGGCACCTCCTCAATGGTCCACTTCCCACCCCCGCCGAATCATATCTCGTGTGTCTGCTTTTTCACCCCCAAATTTCTCCCCATCATTCGGTTGTTTCCCTCAAAAATCGAAATCAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001169
ATGGTCCACTTCCCACCCCCGCCGAATCATATCTCGTGTGTCTGCTTTTTCACCCCCAAATTTCTCCCCATCATTCGGTTGTTTCCCTCAAAAATCGAAATCAAAATCCCAATTCTTAATTCAACTCGCCAACCCCAATTTTTTGCCCTAATTTTGCACGTGATTGTGATGATGAATGGTTATGCACATCACGTGGATTCACTCGATGAGAATTGCTGGACCGACTTAATCGATTACAGCAGCCTCTTGGACGACGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783466.1
MVHFPPPPNHISCVCFFTPKFLPIIRLFPSKIEIKIPILNSTRQPQFFALILHVIVMMNGYAHHVDSLDENCWTDLIDYSSLLDDAVPAAGLYWNPQPPAQNACVATDVSFSGTTSHVSDSAEERESRKKRGRSDQCGGTGNKACRERMRREKLNDRFTELSDTLEPGRPAKTDKLAILGDAIRVLNQLKTESEEYKEMNEKLLEEIKTLKAEKNELREEKLVLKTDKERMEQQLKSMAVPPTGFMPAHPPVYPAAPNKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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