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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001632`

染色体: Chr08 坐标: 13505512-13506387 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001632`
名称	SmilChr08G001632
描述	uncharacterized SmilChr08G001632
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13505512 - 13506387 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998096`
GeneID	`130998096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998096`
原始查询	`SmilChr08G001632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ankyrin-repeat containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830351]; symbol=AT5G04730; hit=AT5G04730; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ankyrin-repeat containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830351]; symbol=AT5G04730; hit=AT5G04730; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G04730` (AT5G04730) Ankyrin-repeat containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830351] identity=34.9; qcov=0.866; evalue=3.86e-40; confidence=low
Rice	`Os11g0435300` - identity=24.3; qcov=0.636; evalue=1.03e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779512.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779512.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779512.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779512.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13505542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C14
`Chr8:13505563`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A14,A8,B133,B16,B6,B81,C58,C67,C74
`Chr8:13505592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C14
`Chr8:13505616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C19,C31
`Chr8:13505629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr8:13505639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B81,C18,C46
`Chr8:13505662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C14
`Chr8:13505669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr8:13505673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B67,C38,C61,C8
`Chr8:13505676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr8:13505677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A1,A14,A19,A25,B112,B127,B15,B2,B4,B55,B59,B97,C1,C23,C28,C29,C5,C59,D10
`Chr8:13505683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A1,A14,A19,A25,B112,B127,B15,B2,B4,B55,B59,B97,C1,C23,C28,C29,C5,C59,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779512.1

291 aa

146

291

PGG

PF13962 PGG 103-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779512.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	103	214	5.9e-24	84.8	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923529.1
ATGCTCGCAGCTGAGTACAGGCATACCGCCGTATTCAATTATCTCTGCAACTTAAAGCTTCCCGAATACATGTTTCGGCAGTTCGATAAGGATGGGAACAACATCCTGCACCTCGCCGCCAAGCTCACCGAGCTCTACCCTTGGCGAATCCCCGGCGCTGCCCTCCAGATGCAGTGGGAGATCAAGTGGTACAAGCATGTCAAAGGAATATTGTTTAATCAGCACATTTCTCAGGCCAACAAGAAAGGGAAAACGCCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998096
ATGCTCGCAGCTGAGTACAGGCATACCGCCGTATTCAATTATCTCTGCAACTTAAAGCTTCCCGAATACATGTTTCGGCAGTTCGATAAGGATGGGAACAACATCCTGCACCTCGCCGCCAAGCTCACCGAGCTCTACCCTTGGCGAATCCCCGGCGCTGCCCTCCAGATGCAGTGGGAGATCAAGTGGTACAAGCATGTCAAAGGAATATTGTTTAATCAGCACATTTCTCAGGCCAACAAGAAAGGGAAAACGCCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779512.1
MLAAEYRHTAVFNYLCNLKLPEYMFRQFDKDGNNILHLAAKLTELYPWRIPGAALQMQWEIKWYKHVKGILFNQHISQANKKGKTPRIVFTETHKDLMKADNEWLIKTSESCSVVAALIAAVAFATSSTVPGGLNQEKGKSVLQDEKAFDVFSVALLVALCLSMTALVFFLAIITSWCEEHDFKRNLPRKLLAGLSPPFASITAILLSFCSGHTFILREELKFAVIPIYASVTIPVAFFAIAQLPLYFDLLWAACKKVPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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