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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001639`

染色体: Chr08 坐标: 13595164-13597037 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001639`
名称	SmilChr08G001639
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase RAM2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13595164 - 13597037 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001182`
GeneID	`131001182`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001182`
原始查询	`SmilChr08G001639`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase RAM2-like
产物	glycerol-3-phosphate acyltransferase RAM2-like
Arabidopsis	`AT2G38110` (GPAT6) glycerol-3-phosphate acyltransferase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818389] identity=49.4; qcov=0.998; evalue=1.33e-170; confidence=high
Rice	`Os03g0735900` (GPAT) - identity=58.3; qcov=0.914; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0010143 (cutin biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016791 (phosphatase activity); GO:0090447 (glycerol-3-phosphate 2-O-acyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01553 (Acyltransferase); PF12710 (HAD); PF23270 (HAD_RAM2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001182

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057783479.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057783479.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783479.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783479.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783479.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13595290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B139
`Chr8:13595382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr8:13595532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B80
`Chr8:13595556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C14
`Chr8:13595593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B7,C33
`Chr8:13595607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:13595676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr8:13595704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B137,C11,C69
`Chr8:13595726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:13595727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:13595764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:13595804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783479.1

501 aa

250

501

HAD_RAM2_N

HAD

Acyltransferase

PF23270 HAD_RAM2_N 25-214 aa PF12710 HAD 26-206 aa PF01553 Acyltransferase 299-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783479.1`	Pfam	`PF23270`	HAD_RAM2_N	Domain	25	214	5.4e-61	206.3	Glycerol-3-phosphate acyltransferase RAM2-like, HAD-like domain
`XP_057783479.1`	Pfam	`PF12710`	HAD	Family	26	206	6.7e-23	82.8	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057783479.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	299	402	1.1e-10	42.1	Acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927496.1
GCTAGATTGGCGGGTCCAATTGTTAAATTAGGACAAAAAGAAGTTTATAAACCCAATCTTCGTCATTACATCTTTGATACAACAACACATGATCTGCTTTGGCTTATATATTTATATATGTTGTAAAGTGTAACTTTGTAACCAAATAATTGTGGTAAACCACAAAGTCTCATGACAATGGCTAGCAGAGACAGATTAATCCCAACAATCTACGAATGCGACTCCAACAATCGACAAAATCACACCGTGGTTTCCGACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001182
ATGACAATGGCTAGCAGAGACAGATTAATCCCAACAATCTACGAATGCGACTCCAACAATCGACAAAATCACACCGTGGTTTCCGACATGGACGGAACGTTGCTGGTGGGCCGCAGCTCCTTCGCTTATTTCGCGTTGATTGCATTCGACGTGGGAGGAATCCTGCGGCTACTGCTGCTGCTGTTAGCGGCTCCGTTTGTCGGCCTTCTCTACTACTTCGTATCGGAATCTGCGGGCATTAAGGTGCTCATATTCGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783479.1
MTMASRDRLIPTIYECDSNNRQNHTVVSDMDGTLLVGRSSFAYFALIAFDVGGILRLLLLLLAAPFVGLLYYFVSESAGIKVLIFATFAGVKVSSIKSAARAVLPKHYSDDLHPETWRVFSSCGRKCVLTANPRIMVEPFLNNYLDVDVVLGTEISSFKGVATGLVAAPGVLVGENKAVALRKAFGDQEMPHVGMGDRDTDIPFLKLCKEKYMVPARPGTRPVRAETLPKPVIFHDGRLVQKPTLSRALLITLWLPFGII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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