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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001641`

染色体: Chr08 坐标: 13618463-13621332 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001641`
名称	SmilChr08G001641
描述	uncharacterized SmilChr08G001641
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13618463 - 13621332 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001184`
GeneID	`131001184`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001184`
原始查询	`SmilChr08G001641`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding ASCH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816560]; symbol=AT2G20410; hit=AT2G20410; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding ASCH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816560]; symbol=AT2G20410; hit=AT2G20410; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G20410` (AT2G20410) RNA-binding ASCH domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816560] identity=65.8; qcov=0.838; evalue=2.38e-106; confidence=high
Rice	`Os03g0860000` - identity=75; qcov=0.453; evalue=3.44e-69; confidence=medium
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04266 (ASCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001184

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057783481.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057783481.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057783481.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057783481.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783481.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13618685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:13618785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr8:13618895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B137,C11,C46,C69
`Chr8:13618947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B136,B51,B6,B61
`Chr8:13619161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B136,B6,B61
`Chr8:13619301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B82,C20,C48
`Chr8:13619483`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr8:13619483`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr8:13620867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B137,C11,C46,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783481.1

265 aa

132

265

ASCH

PF04266 ASCH 16-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783481.1`	Pfam	`PF04266`	ASCH	Domain	16	133	3.2e-17	63.4	ASCH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927498.1
GGAATTTCGAACTTATCTACAAATTTTTTTATGGATGCTTTGCTAAATTGGTGTAGTAATTTGTTTATGTTGGCCCTACAATCTACATGATGGATTTATGTTTGCGATCTTTGAATCAGAAAAGGATTACTATAAAGAAGTTTCCCCCAGAAAAAGGAACAAGAAAAAAGAGACATGAGTTTTTTTTACTTCTTTTACCGATCGAATTCACTATTTATTGATTAAAAAAAAAAAAAAACAACGACAACAACAACAGAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001184
ATGGCGAGCCGGAGTAGGGAATCGTCGAATTACAGAAACCCATGTTTAACAATGCACCAACCATGGGCGTCTTTGCTTGTTTATGGCATCAAACGGATTGAAGGCAGATCTTGGCCCGCCCCAATTAGAGGACGGCTGTGGATTCATGCAGCTGGTAAGGTCCCTGAACCAGAGACAATCAAAGCTATGGAAGATTTTTACAGGCAGATCTACGCAATGAATGGAGTAACAGATATCGAATTCCCTGAGTATTACCCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783481.1
MASRSRESSNYRNPCLTMHQPWASLLVYGIKRIEGRSWPAPIRGRLWIHAAGKVPEPETIKAMEDFYRQIYAMNGVTDIEFPEYYPVSRLLGCVDVVGCVTCEELVNWEAIPASVRVEGQTAFCWLCEQPQRLIVPFEMRGFQGVYNLEKKIYEAAVRGLSSVKAPQPVTFPLPDPRDRFSLKPGSLASLPSCTNALEEEKPPSLVAAIAAARAAATQFSKNKSPETPKAGNIEGNKKPISMRTRNKSEERVPVQRPGGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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