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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001646`

染色体: Chr08 坐标: 13658144-13658900 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001646`
名称	SmilChr08G001646
描述	probable protein phosphatase 2C 22
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13658144 - 13658900 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998098`
GeneID	`130998098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998098`
原始查询	`SmilChr08G001646`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 22
产物	probable protein phosphatase 2C 22
Arabidopsis	`AT2G25620` (DBP1) DNA-binding protein phosphatase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817102] identity=71.7; qcov=1.01; evalue=1.65e-101; confidence=high
Rice	`Os06g0597200` (OsPP2C57) - identity=73.1; qcov=0.954; evalue=1.05e-98; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779515.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779515.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779515.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779515.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13658345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:13658375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A10
`Chr8:13658375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:13658387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B1,C22,C62
`Chr8:13658452`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B56,B71,C18
`Chr8:13658452`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B56,B71,C18
`Chr8:13658458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,B75
`Chr8:13658494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A3,B68,B75,C51
`Chr8:13658514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:13658549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B59,C56
`Chr8:13658561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:13658604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779515.1

195 aa

195

PP2C

PF00481 PP2C 9-151 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779515.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	9	151	3.1e-46	158.8	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923532.1
AATCTTGCAATTGCTAGTATATGCTCACTGGTGGTGGCGAATGCTGGAGACTGCAGAGCAATGCTGTGTCGAAGGGGCAAAGCAATTGAGATGTCGAGAGATCATAAACCCGTTTGCTTGAGGGAGCTGCGTCGTATAGAAGCCTCGGGAGGTTATGTATACGATGGGCATCTCAACGGGCTGCTCAACGTTGCTCGTGCATTGGGCGACTGGCACATGGAAGGGCTGAAAGGTGGTGATGGCGGACCACTTACATTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998098
AATCTTGCAATTGCTAGTATATGCTCACTGGTGGTGGCGAATGCTGGAGACTGCAGAGCAATGCTGTGTCGAAGGGGCAAAGCAATTGAGATGTCGAGAGATCATAAACCCGTTTGCTTGAGGGAGCTGCGTCGTATAGAAGCCTCGGGAGGTTATGTATACGATGGGCATCTCAACGGGCTGCTCAACGTTGCTCGTGCATTGGGCGACTGGCACATGGAAGGGCTGAAAGGTGGTGATGGCGGACCACTTACATTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779515.1
NLAIASICSLVVANAGDCRAMLCRRGKAIEMSRDHKPVCLRELRRIEASGGYVYDGHLNGLLNVARALGDWHMEGLKGGDGGPLTLEPDLMTTRLTKEDEFLVIGCDSLWDVFLSQNALDFARRRLQEHNDPLMCSKDLVDKALKQRSGDNLSVVVVCIQPEPPPNLVVPRGRVHQSISTEGLKELQSFLDDLDI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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