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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001650`

染色体: Chr08 坐标: 13709617-13710488 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001650`
名称	SmilChr08G001650
描述	uncharacterized SmilChr08G001650
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13709617 - 13710488 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001194`
GeneID	`131001194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001194`
原始查询	`SmilChr08G001650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815012]; symbol=AT2G04690; hit=AT2G04690; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815012]; symbol=AT2G04690; hit=AT2G04690; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G04690` (AT2G04690) Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815012] identity=36.8; qcov=0.989; evalue=4.95e-28; confidence=medium
Rice	`Os06g0238300` - identity=33.6; qcov=0.797; evalue=1.03e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13883 (CREG_beta-barrel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057783491.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783491.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783491.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783491.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783491.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13709777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:13709898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:13709946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B18
`Chr8:13710031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:13710190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:13710212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783491.1

193 aa

193

CREG_beta-barrel

PF13883 CREG_beta-barrel 30-191 aa

XP_057783492.1

187 aa

187

CREG_beta-barrel

PF13883 CREG_beta-barrel 30-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783491.1`	Pfam	`PF13883`	CREG_beta-barrel	Domain	30	191	4.8e-24	85.9	CREG, beta-barrel
`XP_057783492.1`	Pfam	`PF13883`	CREG_beta-barrel	Domain	30	185	7.9e-18	65.7	CREG, beta-barrel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927509.1
GTTTTCAAAAAAAAAAATAGCGATAGAAGCTTTCGAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGCGATAATATTGCAGCTATGGCTAATTCGTTGTTGTTTTGTGGCATTGCTTTACTAACAATGGTTTCAGTGAGCAGTCTGAGGTCCGGTGGCGGCGATCCTCGACCGGATATAGACAAAGTGCCTGAATTTGCGAGATGGCTTGTCCGGCGTGCCAAGTTTGGCACTCTAGCGATCGTGCAGATGGTGGAGGTACCGGAGCCGTTC...

XM_057927508.1
TTTTCAAAAAAAAAAATAGCGATAGAAGCTTTCGAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGCGATAATATTGCAGCTATGGCTAATTCGTTGTTGTTTTGTGGCATTGCTTTACTAACAATGGTTTCAGTGAGCAGTCTGAGGTCCGGTGGCGGCGATCCTCGACCGGATATAGACAAAGTGCCTGAATTTGCGAGATGGCTTGTCCGGCGTGCCAAGTTTGGCACTCTAGCGATCGTGCAGATGGTGGAGGTACCGGAGCCGTTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001194
ATGGCTAATTCGTTGTTGTTTTGTGGCATTGCTTTACTAACAATGGTTTCAGTGAGCAGTCTGAGGTCCGGTGGCGGCGATCCTCGACCGGATATAGACAAAGTGCCTGAATTTGCGAGATGGCTTGTCCGGCGTGCCAAGTTTGGCACTCTAGCGATCGTGCAGATGGTGGAGGTACCGGAGCCGTTCGGGTACATCGCTTCTTACAGCGATGGCGGCACCGGAAGCCCCTATTTTTATCTATCCTCACTCGACCCGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783491.1
MANSLLFCGIALLTMVSVSSLRSGGGDPRPDIDKVPEFARWLVRRAKFGTLAIVQMVEVPEPFGYIASYSDGGTGSPYFYLSSLDPAGAYASTNTALACLTISEVFINGCGGVDPQSPGCAKVALTGRLRMLPGDSDEGGMAEGALFRDHPAFARFPRQNGTFAVYKLDIERIFLVNKAAPARDLTVDDYFDA

XP_057783492.1
MANSLLFCGIALLTMVSVSSLRSGGGDPRPDIDKVPEFARWLVRRAKFGTLAIVQMVEVPEPFGYIASYSDGGTGSPYFYLSSLDPAGAYASTNTALACLTISEVFINGCGGVDPQSPGCAKLRMLPGDSDEGGMAEGALFRDHPAFARFPRQNGTFAVYKLDIERIFLVNKAAPARDLTVDDYFDA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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