当前解析结果
SmilChr08G001659| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001659 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001659 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G001659 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 13795018 - 13800104 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001202 |
|---|---|
| GeneID | 131001202 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001202 |
| 原始查询 | SmilChr08G001659 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OSJNBb0007E22.16; symbol=OSJNBb0007E22.16; hit=Os03g0611200; species=rice; confidence=high |
| 产物 | OSJNBb0007E22.16; symbol=OSJNBb0007E22.16; hit=Os03g0611200; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G04420 (AT1G04420)NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839524] identity=73.4; qcov=0.877; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os03g0611200 (OSJNBb0007E22.16)- identity=71.6; qcov=0.906; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0016491 (oxidoreductase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00248 (Aldo_ket_red) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001202 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057783500.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 1.00000 | XP_057783500.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783500.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783500.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057783500.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:13795679 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr8:13799352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr8:13799805 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr8:13799843 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057783500.1PF00248
Aldo_ket_red 74-405 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057783500.1 |
Pfam | PF00248 |
Aldo_ket_red | Domain | 74 | 405 | 9.2e-65 | 219.3 | Aldo/keto reductase family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。