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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001660`

染色体: Chr08 坐标: 13803394-13807921 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001660`
名称	SmilChr08G001660
描述	putative E3 ubiquitin-protein ligase XBAT35
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13803394 - 13807921 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001205`
GeneID	`131001205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001205`
原始查询	`SmilChr08G001660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative E3 ubiquitin-protein ligase XBAT35
产物	putative E3 ubiquitin-protein ligase XBAT35
Arabidopsis	`AT3G23280` (XBAT35) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821907] identity=55; qcov=1.01; evalue=4.6e-175; confidence=high
Rice	`Os07g0446100` (XBOS34) - identity=49.6; qcov=1.11; evalue=4.21e-160; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF13857 (Ank_5); PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endosome	内体	1.00000	`XP_057783506.1`
2	Endosome membrane	内体膜	1.00000	`XP_057783506.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057783506.1`
4	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057783506.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057783506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13804410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B68
`Chr8:13805381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:13807090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B24,B43,C20,D8
`Chr8:13807100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:13807153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B136,B51,B61
`Chr8:13807288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C59
`Chr8:13807326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B139,C21,C36
`Chr8:13807362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B136,B61
`Chr8:13807438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B6,C53
`Chr8:13807549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B136,B61
`Chr8:13807573`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B50
`Chr8:13807573`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783506.1

461 aa

230

461

Ank

Ank_5

Ank

zf-C3HC4_3

PF00023 Ank 40-69 aa PF13857 Ank_5 60-116 aa PF00023 Ank 78-106 aa PF13920 zf-C3HC4_3 408-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783506.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	40	69	3.2e-12	46.7	Ankyrin repeat
`XP_057783506.1`	Pfam	`PF13857`	Ank_5	Repeat	60	116	2.5e-08	34.8	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057783506.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	78	106	3.2e-12	46.7	Ankyrin repeat
`XP_057783506.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	408	454	1.7e-11	44.4	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927523.1
AGAAACAAAATAAAAAGTTTAAGAAAATAAGAAATAATGATTTCATAATCAGCTTGTAAAAGTCTTGGAAAGGTTCAAGAAAGTGATTACATTTGATTTTCTTCCCTTATTGAGTAAGAAAACATCCTCATATGTAACCTCTCCATATCCGGAGCTGCGACGCCCCCAATTCACCAATTCTTTGTTTATATAATATCACTCGTTTATTTTTCTTTCTCTTATCCTCTTGGGATCTTTTTTCTTAACGAATTCAGCGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001205
ATGGGGCAGCAACAATCTAAAGATCAATTGCTGTTTCAGCAGGTTAATTATGGGAATATTGAGGGCATCAAAGCTCTCCGAAGTCAAGGTGCTGGGCTTGAGTGGATTGACAGTGAAGGCAAGACAGCGTTGATTGTAGCTTGCATGAACCCACAGCTTTATAATGTAGCAAAAACATTGATTGAATTAGGTGCCAATGTCAATGTATACCGTCCAGGTCGCCATGCAGGAACTCCTTTACATCATGCTGCCAAAAGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783506.1
MGQQQSKDQLLFQQVNYGNIEGIKALRSQGAGLEWIDSEGKTALIVACMNPQLYNVAKTLIELGANVNVYRPGRHAGTPLHHAAKRGLDQTVKLLLSHGANALIMNDDCHTPLDLARAKGFGNVVRAIEGHLCLFSGWLRELYGPGFLERLAPQLLSRKVWVVVLPCGSRNLARPFKLELAIYAGPQDAKPSTTIQLWKANLEEPNFGQPDPAAIISDISKSTRIKLAPASESEKHQLQRFCNACKGIPQVMHPSFPFDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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