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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001664`

染色体: Chr08 坐标: 13865120-13868982 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001664`
名称	SmilChr08G001664
描述	uncharacterized protein At4g14342
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	13865120 - 13868982 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001210`
GeneID	`131001210`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001210`
原始查询	`SmilChr08G001664`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0278966; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os08g0278966; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G23325` (AT3G23325) Splicing factor 3B subunit 5/RDS3 complex subunit 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821913] identity=90.8; qcov=1; evalue=1.54e-59; confidence=high
Rice	`Os08g0278966` - identity=92; qcov=1; evalue=4.51e-60; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0071011 (precatalytic spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07189 (SF3b10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001210

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057783511.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057783513.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057783511.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057783513.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057783513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:13865687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C7
`Chr8:13865877`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A11,B103,B106,B118,B36,B50,B53,B58,B72,B75,B76,B78,B90,C11,C26,C31,C32,C35,C39,C49,C61,C68,C69,C72,C73
`Chr8:13865982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A14,A5,B100,B107,B117,B121,B123,B133,B139,B14,B27,B29,B30,B38,B39,B48,B50,B54,B66,B69,B73,B81,B89,B95,C74,C78,C79,D3,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783511.1

149 aa

149

SF3b10

PF07189 SF3b10 5-72 aa

XP_057783513.1

87 aa

SF3b10

PF07189 SF3b10 5-82 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783511.1`	Pfam	`PF07189`	SF3b10	Family	5	72	6.8e-32	110.1	Splicing factor 3B subunit 10 (SF3b10)
`XP_057783513.1`	Pfam	`PF07189`	SF3b10	Family	5	82	7.6e-38	129.2	Splicing factor 3B subunit 10 (SF3b10)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927528.1
GGTGAGAGAGACTGCTAGAGTCTAGAGATATTCTCAGCGTTTACAAGAGTCGCTATTTCAGTTATCAGTTACACGCTTACTATTCTACACTATAAACACTCGACCATATACCGCTCATTTCTTCTTCAGCTCATTCTGACTGTTCAATATGCAGGCGAGCGACAGGTTTAATATAAACTCGCAGCTCGAGCATTTGCAGGCTAAATATGTCGGTACAGGGCACGCCGACTTGACTCGATTTGAATGGGCGGTGAATATCC...

XM_057927530.1
AGAGAGACTGCTAGAGTCTAGAGATATTCTCAGCGTTTACAAGAGTCGCTATTTCAGTTATCAGTTACACGCTTACTATTCTACACTATAAACACTCGACCATATACCGCTCATTTCTTCTTCAGCTCATTCTGACTGTTCAATATGCAGGCGAGCGACAGGTTTAATATAAACTCGCAGCTCGAGCATTTGCAGGCTAAATATGTCGGTACAGGGCACGCCGACTTGACTCGATTTGAATGGGCGGTGAATATCCACCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001210
ATGCAGGCGAGCGACAGGTTTAATATAAACTCGCAGCTCGAGCATTTGCAGGCTAAATATGTCGGTACAGGGCACGCCGACTTGACTCGATTTGAATGGGCGGTGAATATCCACCGAGATAGCTACGCCTCGTACGTCGGGCATTATCCGATTCTGGCCTACTTTGCCGTCGCTGAAAATGAATCCATTGGGAGAGAGCGCTACAATTTCATGCAGAAAATGCTTTTGCCGTGTGGGCTTCCTCCCGAGAGAGAAGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783511.1
MQASDRFNINSQLEHLQAKYVGTGHADLTRFEWAVNIHRDSYASYVGHYPILAYFAVAENESIGRERYNFMQVCLLYAFFVCVCVCVWSMSSHLVKIRYLNFVGVEFSKFLFISPFNFSISWIWSWWGLFLLWNLDGKCVTDLTLKMPQ

XP_057783513.1
MQASDRFNINSQLEHLQAKYVGTGHADLTRFEWAVNIHRDSYASYVGHYPILAYFAVAENESIGRERYNFMQKMLLPCGLPPEREDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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