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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001678`

染色体: Chr08 坐标: 14012039-14012837 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001678`
名称	SmilChr08G001678
描述	uncharacterized SmilChr08G001678
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14012039 - 14012837 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998101`
GeneID	`130998101`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998101`
原始查询	`SmilChr08G001678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=35.6; qcov=1.08; evalue=1.35e-39; confidence=medium
Rice	`Os03g0643050` - identity=45; qcov=0.977; evalue=1.48e-57; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998101

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779518.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057779518.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779518.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779518.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14012076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:14012126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,D11,D5
`Chr8:14012191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B124,C74
`Chr8:14012191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C74
`Chr8:14012208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr8:14012246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr8:14012247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B1
`Chr8:14012269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B83,C10,C15,C5
`Chr8:14012312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B95,C74,C77,C79
`Chr8:14012365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr8:14012377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr8:14012378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779518.1

216 aa

108

216

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 8-138 aa PF01609 DDE_Tnp_1 12-153 aa PF04827 Plant_tran 98-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779518.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	8	138	4.5e-21	75.8	DDE superfamily endonuclease
`XP_057779518.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	12	153	6e-07	30.1	Transposase DDE domain
`XP_057779518.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	98	155	6.4e-05	23.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923535.1
CTAGGGTTGTCTTGGTGCCTTAGATGGCACCTATGTCGACGTGATGGTTGGCATTAGTGACAAACCGCGATATAGAACAAGAAAAGGGCAAATATCAACCAATGTATTGGGTGTATGTGATCGTAACCTGCAGTTCGTGTACGTACTGTCCGGTTGGGAAGGATCTGCCGCGGATTCTAGAGTCCTAAGAGATGCTCTTAATAGACCTCACGGTCTTAAGGTTCCAAAGGGAAACTATTACTTGTGTGACAATGGTTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998101
ATGGTTGGCATTAGTGACAAACCGCGATATAGAACAAGAAAAGGGCAAATATCAACCAATGTATTGGGTGTATGTGATCGTAACCTGCAGTTCGTGTACGTACTGTCCGGTTGGGAAGGATCTGCCGCGGATTCTAGAGTCCTAAGAGATGCTCTTAATAGACCTCACGGTCTTAAGGTTCCAAAGGGAAACTATTACTTGTGTGACAATGGTTATGCAAATTGTGAGGGGTTTCTAACGCCCTACAAGGGCGTTAGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779518.1
MVGISDKPRYRTRKGQISTNVLGVCDRNLQFVYVLSGWEGSAADSRVLRDALNRPHGLKVPKGNYYLCDNGYANCEGFLTPYKGVRYHLKEWGPTAARPQNKEELFNLRHSKARNAVERAFGIMKMRWGILRSPTFYPIKVQNRLIMASFLINNFIRMEMPVDPIEQELDAMEQANAIGVAVGPDEYIDTVESSPQWNAARDDLAEGMWLQYISTI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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