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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001679`

染色体: Chr08 坐标: 14023790-14029062 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001679`
名称	SmilChr08G001679
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14023790 - 14029062 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001222`
GeneID	`131001222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001222`
原始查询	`SmilChr08G001679`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.2-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.2-like
Arabidopsis	`AT5G46050` (PTR3) peptide transporter 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834646] identity=70.3; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0470700` (OsPTR3) - identity=68.5; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0042937 (tripeptide transmembrane transporter activity); GO:0042938 (dipeptide transport); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0071916 (dipeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057783531.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783531.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783531.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783531.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783531.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14025241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C46
`Chr8:14027151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:14027187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:14027229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C85
`Chr8:14028167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B47,C23
`Chr8:14028293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:14028341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:14028375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C64,C66,D7
`Chr8:14028452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B105,C85,D11
`Chr8:14028496`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A24,B10,B110,B126,B129,B132,B138,B22,B35,B58,B82,B86,B91,C34,C72,C81,D9
`Chr8:14028815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:14028908`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A19,B103,B109,B131,B25,B37,B62,B78,B82,B86,B92,B95,C14,C51,C66,C67,C71,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783531.1

585 aa

292

585

PTR2

PF00854 PTR2 94-517 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783531.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	94	517	3.3e-99	333.2	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927548.1
CAACGCAACTGGTATATAAATTTCAACGGTTCTTGCAATTTGACTATGTGAAGTGTGTATGTTGATATATTTAGCCCCCACAATTCCAATATCCTTTTTTTTTTCAAACTATGTATTTCGTTTTCTTTATTGAGAAAGATTGATTTAAACTTTTAATATTTCAATAAAAGCTGCCTCCAATAAAATTGTTGTCCTAACGAACAAAATATTGGTGAGTAGACGCCAATAAAAGGGTGAGGGTTGAGACACATTAGTGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001222
ATGGAAGATGGATACACAGAAGATGGAACAGTTGATCTCAAAGGAAATCCAGTTCTTAGATCAAAGAGGGGTGGATGGACTGCTTGCTTCTTCGTCGTTGTGTACGAAGTGTTTGAGCGGATGGCTTACTACGGTATATCCACGAATCTCTTCATATACTTGACCAAGAAACTACATCAGGGCACAGTCGAGTCGGCCAACAACGTCACCAATTGGGTCGGAACCATTTGGATGACTCCAGTGCTCGGCGCCTACATAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783531.1
MEDGYTEDGTVDLKGNPVLRSKRGGWTACFFVVVYEVFERMAYYGISTNLFIYLTKKLHQGTVESANNVTNWVGTIWMTPVLGAYIADALLGRYWTFLIACGIYFSGMSLLTIAVSIHPLKPGPCSDPSGVNCKKPTALQVGVFFGALYTLALGTGGTKPNISTIGADQFDEFEPKEKAHKLSFFNWWMFSIFFGTLFANTVLVYIQDNVGWSLGYGLPTIGLAISILIFLAGTPFYRHKLPTGSPFTKMARVIVAAFRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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