当前解析结果
SmilChr08G001687| 统一新 Gene ID | SmilChr08G001687 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G001687 |
| 描述 | protein PROTON GRADIENT REGULATION 5, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 14091887 - 14092844 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131001232 |
|---|---|
| GeneID | 131001232 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131001232 |
| 原始查询 | SmilChr08G001687 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein PROTON GRADIENT REGULATION 5, chloroplastic |
| 产物 | protein PROTON GRADIENT REGULATION 5%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT2G05620 (PGR5)proton gradient regulation 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815111] identity=61.9; qcov=1.17; evalue=2.39e-47; confidence=medium |
| Rice | Os08g0566600 (OsPGR5)- identity=87.9; qcov=0.574; evalue=2.27e-34; confidence=medium |
| GO | GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009644 (response to high light intensity); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131001232 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057783540.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057783540.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 1.00000 | XP_057783540.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057783540.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057783540.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:14092585 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C32 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。