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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001688`

染色体: Chr08 坐标: 14092782-14095822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001688`
名称	SmilChr08G001688
描述	eukaryotic translation initiation factor
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14092782 - 14095822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001231`
GeneID	`131001231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001231`
原始查询	`SmilChr08G001688`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor
产物	eukaryotic translation initiation factor
Arabidopsis	`AT5G35620` (LSP1) Eukaryotic initiation factor 4E protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833534] identity=70.3; qcov=0.985; evalue=4e-95; confidence=high
Rice	`Os10g0467600` (p28) - identity=70; qcov=0.975; evalue=3.47e-100; confidence=high
GO	GO:0000340 (RNA 7-methylguanosine cap binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006413 (translational initiation); GO:0016281 (eukaryotic translation initiation factor 4F complex)
KEGG	-
Pfam	PF01652 (IF4E)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057783538.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057783538.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057783538.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057783538.1`
5	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057783539.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14093055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:14093123`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	63	A11,A15,A18,A2,A3,A5,A8,A9,B101,B105,B108,B109,B114,B12,B121,B122,B124,B13,B135,B138,B22,B25,B26,B3,B35,B4,B47,B53,B57,B60,B63,B66,B68,B70,B78,B8,B80,B91,C11,C15,C16,C22,C34,C36,C38,C4,C46,C50,C51,C55,C63,C65,C67,C69,C72,C75,C8,C82,C85,D11,D4,D6,D8
`Chr8:14094494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:14095559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr8:14095644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B139,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783538.1

206 aa

103

206

IF4E

PF01652 IF4E 26-187 aa

XP_057783539.1

202 aa

101

202

IF4E

PF01652 IF4E 26-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783538.1`	Pfam	`PF01652`	IF4E	Domain	26	187	1.8e-60	204.2	Eukaryotic initiation factor 4E
`XP_057783539.1`	Pfam	`PF01652`	IF4E	Domain	26	196	1.5e-62	211.1	Eukaryotic initiation factor 4E

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927556.1
CAATTAGAAGCTAACTCAAATCTAACCACGGTCAACTGGGGCTCTCTAGTCTCTACCCTTGAAACCCCACACAAATATCTCTCTTCACTCCTTTCTTTCCCAACCCTTTTTTTTCGGTGATTTGATTTGGTCAAATGGCATCTGAGGTGGCGGCTGCAATACCAGAACTCCCGGCCGAGGCGCCGCCCGCGGCGGAGAAGCAGCCACACAAGCTCGAGAGGAAGTGGACATTTTGGTTCGACAACCAATCCAAGCCCAAG...

XM_057927555.1
AATTAGAAGCTAACTCAAATCTAACCACGGTCAACTGGGGCTCTCTAGTCTCTACCCTTGAAACCCCACACAAATATCTCTCTTCACTCCTTTCTTTCCCAACCCTTTTTTTTCGGTGATTTGATTTGGTCAAATGGCATCTGAGGTGGCGGCTGCAATACCAGAACTCCCGGCCGAGGCGCCGCCCGCGGCGGAGAAGCAGCCACACAAGCTCGAGAGGAAGTGGACATTTTGGTTCGACAACCAATCCAAGCCCAAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131001231
ATGGCATCTGAGGTGGCGGCTGCAATACCAGAACTCCCGGCCGAGGCGCCGCCCGCGGCGGAGAAGCAGCCACACAAGCTCGAGAGGAAGTGGACATTTTGGTTCGACAACCAATCCAAGCCCAAGCAGGGCGGCGCCGCCTGGGGCTCTTCTCTTCGCAAGGGATATACTTTCGACACCGTCGAAGAATTCTGGTGTTTATATGATCAGATATTTAGACCCAGCAAGTTCCCTGCAAATGCTGATTTTCACTTATTCAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057783538.1
MASEVAAAIPELPAEAPPAAEKQPHKLERKWTFWFDNQSKPKQGGAAWGSSLRKGYTFDTVEEFWCLYDQIFRPSKFPANADFHLFKAGVEPKWEDPECANGGKWTVTSNKKSDLDNMWLQTLMALIGEQFDDADEICGVVASVRQKQDKLSLWTKTAANEAAQMGIGRKWKEVIDITDKISYGFHVRIIALSMYCTLGYLLFLMF

XP_057783539.1
MASEVAAAIPELPAEAPPAAEKQPHKLERKWTFWFDNQSKPKQGGAAWGSSLRKGYTFDTVEEFWCLYDQIFRPSKFPANADFHLFKAGVEPKWEDPECANGGKWTVTSNKKSDLDNMWLQTLMALIGEQFDDADEICGVVASVRQKQDKLSLWTKTAANEAAQMGIGRKWKEVIDITDKISYGFHDDSRRESRAPRSRYQV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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