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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001690`

染色体: Chr08 坐标: 14113414-14116855 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001690`
名称	SmilChr08G001690
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14113414 - 14116855 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001235`
GeneID	`131001235`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001235`
原始查询	`SmilChr08G001690`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 2
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 2
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=28.6; qcov=0.901; evalue=4.35e-51; confidence=low
Rice	`Os06g0286500` (Nbs1-Pi9) - identity=25.4; qcov=0.967; evalue=2.11e-34; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13401 (AAA_22); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001235

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057783544.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057783544.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057783544.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057783544.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783544.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14114363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A6
`Chr8:14114363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr8:14114419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B8,B9,C16,C40
`Chr8:14114476`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr8:14114476`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr8:14114618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B4
`Chr8:14114618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr8:14114870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:14115446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B139
`Chr8:14115672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B68
`Chr8:14115785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:14115887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783544.1

766 aa

383

766

NB-ARC

AAA_22

LRR_14

PF00931 NB-ARC 70-204 aa PF13401 AAA_22 86-190 aa PF23598 LRR_14 427-724 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783544.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	70	204	9.1e-24	84.7	NB-ARC domain
`XP_057783544.1`	Pfam	`PF13401`	AAA_22	Domain	86	190	4.8e-08	34.1	AAA domain
`XP_057783544.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	427	724	1.4e-24	87.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927561.1
CAACATTTTGTAATTATACAGTTTTCTGACAAATTTATGTGCGTTCACACCTAAAAACAAATGAAATTTAATTATGGCCGAATGCAGGTGCCATATTGACTTATAGTAGCTTCAAAATCCCACGGAAAAGATAAGAGAGGGTGCTTGAATCTTCCTTCCTGGTGCTAATATAAATCAAGTGTTGGTTTGGTGTTAATTTATTTGAGTGGAGAATTAAGATGACATCGGTGGGCGTGATTTCCAGCGTGGTGGCGAGGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131001235
ATGCAGGGAGATAGCTCTGACGGCGCCGCTTCAGAAGTGGAGCCACTCCAACGGAAGAAAAGTGAAAATCCAGTCATGGCGCATTTTCGAAAGATCATACCCATCCATTCCAAATCCAAGAATTCCAGAGAAAAGAAGGGCGGCCCAGAGCAGAAATCCGGTTCGGAGAGAAGCACCAGCGGTTCAGAGGATGTGGATGTGCTACATGAGAAGATAAGGACGGAGTTGTTGAATCCATCTCCCAAATGTTCAGAGGTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783544.1
MQGDSSDGAASEVEPLQRKKSENPVMAHFRKIIPIHSKSKNSREKKGGPEQKSGSERSTSGSEDVDVLHEKIRTELLNPSPKCSEVFVVGESGMGKTTLARKLIEDRQIKERFNFTQLVPINQNFQIKKVLQFLVRQLDAPQQQLEEMNEIQLIHHIFDQLKNKIYLIVFDDVATLDDWESIRLALPLANSNRVIITTSSTQFHQHNCYKISGLSQSQILSLLRNQPAFKLPDSEKIGEAIFRISGGSPLYAEILGKSLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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