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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G001702`

染色体: Chr08 坐标: 14242996-14248654 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G001702`
名称	SmilChr08G001702
描述	pre-mRNA-processing factor 19 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	14242996 - 14248654 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131001245`
GeneID	`131001245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131001245`
原始查询	`SmilChr08G001702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-processing factor 19 homolog 1-like
产物	pre-mRNA-processing factor 19 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT1G04510` (MAC3A) MOS4-associated complex 3A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839503] identity=67.7; qcov=0.842; evalue=1.03e-81; confidence=high
Rice	`Os10g0466300` (OsWD40-178) - identity=63.6; qcov=0.846; evalue=9.25e-76; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0000974 (Prp19 complex); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006281 (DNA repair); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity); GO:0071006 (U2-type catalytic step 1 spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08606 (Prp19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131001245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783561.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057783561.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057783562.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783563.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:14243336`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B52
`Chr8:14243351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:14243373`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B52
`Chr8:14243373`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B52
`Chr8:14243938`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	54	A10,A15,A8,B1,B102,B117,B118,B119,B120,B128,B130,B17,B34,B4,B42,B43,B53,B58,B6,B60,B62,B64,B84,B87,B90,B92,B94,C10,C28,C3,C30,C31,C38,C39,C41,C51,C52,C55,C6,C63,C65,C67,C71,C72,C81,C83,C84,C87,C9,D1,D10,D2,D8,D9
`Chr8:14243999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr8:14246963`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A11,A16,A24,A3,B126,B16,B28,B48,B50,B58,B7,B70,B76,B78,B93,C2,C22,C25,C29,C31,C32,C35,C39,C4,C43,C44,C47,C49,C68,C86,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783561.1

276 aa

138

276

Prp19

PF08606 Prp19 79-144 aa

XP_057783562.1

261 aa

130

261

Prp19

PF08606 Prp19 96-129 aa

XP_057783563.1

238 aa

119

238

Prp19

PF08606 Prp19 41-106 aa

XP_057783564.1

221 aa

110

221

Prp19

PF08606 Prp19 24-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783561.1`	Pfam	`PF08606`	Prp19	Domain	79	144	1.4e-21	76.9	Prp19/Pso4-like
`XP_057783562.1`	Pfam	`PF08606`	Prp19	Domain	96	129	2e-10	41.2	Prp19/Pso4-like
`XP_057783563.1`	Pfam	`PF08606`	Prp19	Domain	41	106	9.6e-22	77.5	Prp19/Pso4-like
`XP_057783564.1`	Pfam	`PF08606`	Prp19	Domain	24	89	8.4e-22	77.7	Prp19/Pso4-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927578.1
TATGAAGCGGCATTCGGATTTTCTGCAAAAAGATCAAGGAAATGCAAACACATCGTGGTTTATCTCCATTTCTCCCCATTCAGTTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCTCTCTCTTCTCTGAACGTGGAGACAGCCCTAGCGCGCCATAGCACACACCGTGAATACTTCGCACGATGCATTGCTCAATTTCCGGCGAGTTGCCGGATGAACCCGTCTTATCCAAGAAATCCGGCC...

XM_057927579.1
TATGAAGCGGCATTCGGATTTTCTGCAAAAAGATCAAGGAAATGCAAACACATCGTGGTTTATCTCCATTTCTCCCCATTCAGTTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCTCTCTCTTCTCTGAACGTGGAGACAGCCCTAGCGCGCCATAGCACACACCGTGAATACTTCGCACGATGCATTGCTCAATTTCCGGCGAGTTGCCGGATGAACCCGTCTTATCCAAGAAATCCGGCC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131001245
ATGCATTGCTCAATTTCCGGCGAGTTGCCGGATGAACCCGTCTTATCCAAGAAATCCGGCCTCCTCTTCGAGAAGCACTTAATTGAGCTCTTCATTTTGGATCATGGAAAATGTCCAGTTACTGAAGAGCCCTTGACAATGGATGATATCATTCCCATCAAGACTGGAAAGTTATGCACTTTCAAAAGTGCGATTAAGATATGTTTGCAGATAGCAAAGCCTCGACCGGTGCAGGCTGCAAGTATTCCTGGGATGCTTGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057783561.1
MHCSISGELPDEPVLSKKSGLLFEKHLIELFILDHGKCPVTEEPLTMDDIIPIKTGKLCTFKSAIKICLQIAKPRPVQAASIPGMLGMFQIEWDGLMLSNYALDQQLHSASPRQELSHALYQYDAACHVARMKKERDEARVLLAQAERRIPASVEVPNTVNAVAISNGKRGAEDDELGPNAKRMHPGISTSIISELADYNALLSQQRKKRQIPSTLAPIDAVERYTQLTVNPLHKTNKPGILSLDIQYSKKRVALTNFSN...

XP_057783562.1
MHCSISGELPDEPVLSKKSGLLFEKHLIELFILDHGKCPVTEEPLTMDDIIPIKTGKLCTFKSAIKICLQIAKPRPVQAASIPGMLGMFQILHSASPRQELSHALYQYDAACHVARMKKERDEARVLLAQAERRIPASVEVPNTVNAVAISNGKRGAEDDELGPNAKRMHPGISTSIISELADYNALLSQQRKKRQIPSTLAPIDAVERYTQLTVNPLHKTNKPGILSLDIQYSKKRVALTNFSNKCTRSGTLIPGRDQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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